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我有一个脚本,我试图提交到SGE集群(在Redhat Linux上)。脚本的第一个部分定义了从完全CWD路径当前文件夹,作为一个变量来在下游使用:SGE集群 - 脚本提交后失败 - 在终端中工作
#!/usr/bin/bash
#
#$ -cwd
#$ -A username
#$ -M [email protected]
#$ -j y
#$ -m aes
#$ -N test
#$ -o test.log.txt
echo 'This is a test.'
result="${PWD##*/}"
echo $result
在bash,这按预期工作:
CWD:
-bash-4.1$ pwd
/home/user/test
运行脚本:
-bash-4.1$ bash test.sh
This is a test.
test
当我将作业提交到集群:
-bash-4.1$ qsub -V test.sh
和检查日志文件:
This is a test.
Missing }.
有谁知道为什么提交作业是在说“缺少}”,当它在命令行的作品吗?我不确定我在这里错过了什么。
谢谢。
我无法复制它。我建议尝试的是运行命令'qrsh'通过SGE登录到一个节点。然后从那里运行你的脚本。它并不完全一样,但我可以帮你找到问题。 –