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我正在使用常规网络的NxN
,我想绘制它的边缘长度分布。Python:常规网络的边缘长度分布
我这是怎么生成网:
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
N=30 #This can be changed
G=nx.grid_2d_graph(N,N)
pos = dict((n, n) for n in G.nodes())
labels = dict(((i, j), i + (N-1-j) * N) for i, j in G.nodes())
nx.relabel_nodes(G,labels,False)
inds=labels.keys()
vals=labels.values()
inds.sort()
vals.sort()
pos2=dict(zip(vals,inds))
nx.draw_networkx(G, pos=pos2, with_labels=False, node_size = 15)
我这是怎么计算边长分布:
def plot_edge_length_distribution(): #Euclidean distances from all nodes
lengths={}
for node in G.nodes():
neigh=nx.all_neighbors(G,node) #The connected neighbors of node n
for n in neigh:
lengths[node]=((pos2[n][1]-pos2[node][1])**2)+((pos2[n][0]-pos2[node][0])**2) #The square distance
items=sorted(lengths.items())
fig=plt.figure()
ax=fig.add_subplot(111)
ax.plot([k for (k,v) in items],[v/(num_edges) for (k,v) in items],'ks-')
ax.set_xscale("linear")
ax.set_yscale("linear")
plt.yticks(numpy.arange(0.94, 1.00, 0.02))
title_string=('Edge Length Distribution')
subtitle_string=('Lattice Network | '+str(N)+'x'+str(N)+' nodes')
plt.suptitle(title_string, y=0.99, fontsize=17)
plt.title(subtitle_string, fontsize=9)
plt.xlabel('Edge Length L')
plt.ylabel('p(L)')
ax.grid(True,which="both")
plt.show()
plot_edge_length_distribution()
这是我获得:有什么不对的字典lengths
由于常规网格的性质,应该只包含一个值。
这就是我想要的:一个告诉我长度= 1的图有一个概率p(l)= 1,因为常规网格只具有长度为1的边。我的代码有什么问题?
尝试首先在要打印的项目的'items','[k处的值(K,V) ]'和'[v /(num_edges)for(k,v)in items]'。 – JulienD