如何延长igraph网络图（layout = fruchterman.reingold）中的边缘？

Question

试图在R做网络图。 如何使用IGraph来加长网络图中的边？

我实际上想使用fruchterman-reingold布局。有什么方法可以使这种基于力的算法“更具弹性”，使我的顶点更加分离？

谢谢。

Answer 1

您可以使用layout.fruchterman.reingold函数来控制Fruchterman-Reingold算法。见：help('layout.fruchterman.reingold')。我经常使用的一个设置，并且让您获得更多的间距：

l <- layout.fruchterman.reingold(g,niter=500,area=vcount(g)^2.3,repulserad=vcount(g)^2.8) 
plot(g,layout=l) 

其中g是您的图形对象。最好只为图表测试这些参数的不同值，看看有什么作用。特别是repulserad会影响图形中的间距。默认值是节点数量的平方，所以更高的值应该让你获得更多的空间图。

Answer 2

如果layout.fruchterman.reingold算法仍然没有通过调整参数给出您想要的值，只需执行以下操作即可。每个布局都会返回一组坐标，其中x和y坐标分别位于第一列和第二列中。你可以在这里应用任何你喜欢的转换，如果你只是想缩放它，只需使用

L = layout.fruchterman.reingold(G)*s; #Scaling factor s 

当然也可以使用更多花哨的转换。为了记录，您还可以使用tkplot(G, layout=L)用鼠标手动编辑布局。您可以通过L = tkplot.getcoords(1)获取坐标。