无法使用“＃”和空格使用read.table或read.csv在R

中读取文件我有一个文件，其中第一行是一个标题。标题可以有空格和＃符号（也可能有其他特殊字符）。我试图用read.csv函数read.table或读取该文件，但它不断抛出我的错误：无法使用“＃”和空格使用read.table或read.csv在R

undefined columns selected 

more columns than column names

我的制表符分隔chromFile文件看起来像：

Chromosome# Chr chr Size UCSC NCBI36/hg18 NCBIBuild36 NCBIBuild37 
1 Chr1 chr1 247199719 247249719 247249719 249250621 
2 Chr2 chr2 242751149 242951149 242951149 243199373

命令：

chromosomes <- read.csv(chromFile, sep="\t",skip =0, header = TRUE, )

我想首先寻找一种方法来读取文件，因为它没有替换空间或＃与其他一些可读的符号。

来源

2012-10-07 user1631306

从文档（?read.csv）：

comment.char字符：包含单个字符或空字符串长度为1的字符向量。使用“”来完全关闭注释的解释。

默认为comment.char = "#"这会给您带来麻烦。按照文档，您应该使用comment.char = ""。

标题中的空格是另一个问题，正如mrdwab指出的那样，可以通过设置check.names = FALSE来解决。

chromosomes <- read.csv(chromFile, sep = "\t", skip = 0, header = TRUE, 
         comment.char = "", check.names = FALSE)

来源

2012-10-07 18:26:27 flodel

添加'check.names = FALSE'，然后我认为答案将是他们正在寻找的。 – A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1

它工作感谢..组合comment.char =“”和check.names = False – user1631306

无法使用“＃”和空格使用read.table或read.csv在R

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