因此,我编写了一个小测试代码来计算文件夹中所有csv文件的平均值。Numpy - ValueError:无法设置序列的数组元素
parser = argparse.ArgumentParser(description='avg data from csv to csv')
parser.add_argument('--input', required = True)
parser.add_argument('--output', required = True)
args = parser.parse_args()
# Get command arguments
input_files_path = args.input
output = args.output
avg = []
for infile in glob.glob(input_files_path+"*.csv"):
a = np.loadtxt(infile, delimiter=",")
mean = np.mean(a, axis=0)
avg.append((mean))
print infile
np.savetxt(output,(avg), fmt = "%.1f", delimiter=", ")
但现在的问题,当我试图保存文件的名称,以及在CSV文件是这样的:
parser = argparse.ArgumentParser(description='avg data from csv to csv')
parser.add_argument('--input', required = True)
parser.add_argument('--output', required = True)
args = parser.parse_args()
# Get command arguments
input_files_path = args.input
output = args.output
avg = []
for infile in glob.glob(input_files_path+"*.csv"):
a = np.loadtxt(infile, delimiter=",")
mean = np.mean(a, axis=0)
avg.append((infile,(mean)))
print infile
np.savetxt(output,(avg), fmt = "%.1f", delimiter=", ")
它抛出一个错误:
np.savetxt(output,(avg), fmt = "%.1f", delimiter=", ")
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/npyio.py", line 963, in savetxt
X = np.asarray(X)
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/numeric.py", line 235, in asarray
return array(a, dtype, copy=False, order=order)
ValueError: cannot set an array element with a sequence
我似乎不明白问题是什么。也许这是因为我试图将一个字符串附加到一个浮点数?我检查fmt
在numpy ..但我没有发现任何有趣的事情。
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/npyio.py:773: UserWarning: loadtxt: Empty input file: "../robalo-31.1/op.csv"
warnings.warn('loadtxt: Empty input file: "%s"' % fname)
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/fromnumeric.py:2374: RuntimeWarning: invalid value encountered in double_scalars
return mean(axis, dtype, out)
我不看行平均' .append((infile,(mean)))'代码中的任何地方。你能否澄清一下如何适合这个? – mgilson
已发布。还有什么我失踪的? 编辑后添加@mgilson – pistal
感谢您的更新。我猜测它与'savetxt'中的'format'部分有关 - 基本上你会告诉numpy将所有东西都保存为float,但是你的数据中有字符串。我可以想象,当numpy尝试将列表转换为ndarray时,可能会搞乱'dtype'参数。我可以推荐您使用'np.savetxt',而不是使用'csv'模块来保存输出文件吗? – mgilson