2014-06-09 74 views
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我已经使下列代码能够用于使用THRUST排序方法对char *数组进行排序。出于某种原因,代码每当它试图比较字符串中的字符时都会中断。CUDA推力装置strcmp

thrust::sort_by_key(deviceArrayToSort.begin(),deviceArrayToSort.end(),deviceArrayToSortRow.begin(),CharArrayCmp()); 

比较器是如下:

struct CharArrayCmp{ 
__host__ __device__ 
    bool operator()(const CharArr & o1, const CharArr & o2) { 
     return this->compare(o1.value,o1.length,o2.value,o2.length); 
    } 

    __host__ __device__ bool compare (const char * src, int lenSrc, const char * dst, int lenDest) 
{ 
    int end; 
    if(lenSrc > lenDest){ 
     end = lenDest; 
    }else{ 
     end = lenSrc; 
    } 
    for(int i = 0; i < end; i++){ 
     if(src[i] > dst[i]){ 
      return false; 
     } 
    } 
    if(lenSrc >= lenDest){ 
     return false; 
    } 
    return true; 
} 

};

当它试图在这条线运行在设备上有一个错误:

if(src[i] != dst[i]) 

    thrust::system::cuda::detail::detail::launch_closure_by_value<thrust::system::cuda::detail:: 
detail::stable_sort_by_count_detail::stable_sort_by_count_closure<256u, 
thrust::detail::normal_iterator<thrust::pointer<unsigned int, 
thrust::system::cuda::detail::tag, thrust::use_default, thrust::use_default> >, 
thrust::detail::normal_iterator<thrust::pointer<unsigned int, 
thrust::system::cuda::detail::tag, thrust::use_default, thrust::use_default> >, 
    thrust::system::cuda::detail::temporary_indirect_ordering<thrust::system::cuda::detail::tag, 
thrust::detail::normal_iterator<thrust::device_ptr<CharArr> >, CharArrayCmp>::compare, 
thrust::system::cuda::detail::detail::statically_blocked_thread_array<256u> > > [0] [device 
0 (GK104)] (Signal) - CUDA_EXCEPTION_10:Device Illegal Address 

CUDA Thread (193,0,0) Block (22,0,0)  


All Kernel Threads (144 Blocks of 256 Threads) 

我很新的CUDA,所以我不确定我在做什么错,但感觉这应该是非常简单。

这是CharArr结构:

typedef struct{ 

char * value; 
int length; 
} CharArr; 

最后这里就是利用这个sort_by_key的代码。我已确保传递给此信息是正确的。即arrayToSort和arrayToSortRow都是数组,分别是char *和long long,size是这两个数组的大小。

void sortCharArrayStable(char ** arrayToSort, long long * arrayToSortRow,long long size){ 
std::cout <<"about to start LongIndex" <<std::endl; 

     thrust::host_vector<CharArr> hostToSort(size); 
     thrust::host_vector<long long> hostToSortRow(size); 
     for(int i =0; i < size; i++){ 
      CharArr sortRow; 
      if(arrayToSort[i] == 0x0){ 
       sortRow.length = 0; 
       sortRow.value = ""; 
       std::cout<<"Had an error on row "<< arrayToSortRow[i]<<" when making column array for sortCharArrayStable"<<std::endl; 

      }else{ 

       sortRow.length = strlen(arrayToSort[i]); 
       sortRow.value = arrayToSort[i]; 
      } 



      hostToSort[i] = sortRow; 
      hostToSortRow[i] = arrayToSortRow[i]; 
     } 
     thrust::device_vector<CharArr> deviceArrayToSort = hostToSort;// (arrayToSort,arrayToSort + size); 
     thrust::device_vector<long long> deviceArrayToSortRow = hostToSortRow; 




thrust::stable_sort_by_key(deviceArrayToSort.begin(),deviceArrayToSort.end(),deviceArrayToSortRow.begin(),CharArrayCmp()); 

     //copy the contents back into our original array to sort now sorted 
     hostToSort = deviceArrayToSort; 
     for(int i =0; i < size; i++){ 
      arrayToSort[i] = hostToSort[i].value; 
     } 
     arrayToSortRow); 


thrust::copy(deviceArrayToSortRow.begin(),deviceArrayToSortRow.end(),arrayToSortRow); 


} 

这里是一个编译例子ocurring问题的一个完整的例子:

#include <thrust/device_vector.h> 
#include <thrust/host_vector.h> 
#include <thrust/reduce.h> 
#include <thrust/device_vector.h> 
#include <thrust/host_vector.h> 
#include <thrust/sort.h> 

#include <thrust/reduce.h> 


typedef struct{ 

    char * value; 
    int length; 
} CharArr; 


struct CharArrayCmp{ 
    __host__ __device__ 
     bool operator()(const CharArr & o1, const CharArr & o2) { 
      return this->compare(o1.value,o1.length,o2.value,o2.length); 
     } 

    __host__ __device__ bool compare (const char * src, int lenSrc, const char * dst, int lenDest) 
    { 
     int end; 
     if(lenSrc > lenDest){ 
      end = lenDest; 
     }else{ 
      end = lenSrc; 
     } 
     for(int i = 0; i < end; i++){ 
      if(src[i] > dst[i]){ 
       return false; 
      } 
     } 
     if(lenSrc >= lenDest){ 
      return false; 
     } 
     return true; 
    } 
}; 


void sortCharArray(char ** arrayToSort, long long * arrayToSortRow,long long size){ 
    std::cout <<"about to start LongIndex" <<std::endl; 

      thrust::host_vector<CharArr> hostToSort(size); 
      thrust::host_vector<long long> hostToSortRow(size); 
      for(int i =0; i < size; i++){ 
       CharArr sortRow; 
       sortRow.value = arrayToSort[i]; 
       sortRow.length = strlen(arrayToSort[i]); 
       hostToSort[i] = sortRow; 
       hostToSortRow[i] = arrayToSortRow[i]; 
      } 
      thrust::device_vector<CharArr> deviceArrayToSort = hostToSort;// (arrayToSort,arrayToSort + size); 
      thrust::device_vector<long long> deviceArrayToSortRow = hostToSortRow;//(arrayToSortRow,arrayToSortRow + size); 

      // thrust::sort(deviceArrayToSort.begin(),deviceArrayToSort.end()); 
      thrust::sort_by_key(deviceArrayToSort.begin(),deviceArrayToSort.end(),deviceArrayToSortRow.begin(),CharArrayCmp()); 

      //copy the contents back into our original array to sort now sorted 
      hostToSort = deviceArrayToSort; 
      for(int i =0; i < size; i++){ 
       arrayToSort[i] = hostToSort[i].value; 
      } 
      thrust::copy(deviceArrayToSortRow.begin(),deviceArrayToSortRow.end(),arrayToSortRow); 


} 

int main() 
{ 
    char ** charArr = new char*[10]; 

    charArr[0] = "zyxw"; 
    charArr[1] = "abcd"; 
    charArr[2] = "defg"; 
    charArr[3] = "werd"; 
    charArr[4] = "aasd"; 
    charArr[5] = "zwedew"; 
    charArr[6] = "asde"; 
    charArr[7] = "rurt"; 
    charArr[8] = "ntddwe"; 
    charArr[9] = "erbfde"; 

    long long * rows = new long long[10]; 
    for(int i = 0; i < 10;i++){ 
     rows[i] = i; 
    } 

    sortCharArray(charArr,rows,10); 

    for(int i = 0; i < 10; i++){ 
     std::cout<<"Row is "<<rows[i]<<" String is "<<charArr[i]<<std::endl; 

    } 
} 
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你试图做什么?排序字符串数组? (在这种情况下,我不清楚为什么你使用“sort_by_key”而不是“sort”)。你传递给排序的比较器的目的是作为*排序*比较器。看起来你的比较器没有这样做 - 它正在测试字符串“相等”。 –

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嘿罗伯特我正在排序char *(c字符串)的数组。 CharArr是一个具有两个值的结构。一个是值(char *),另一个是长度(字符*中的字符数)。我需要这个,因为在比较时我没有看到char *的长度。至于排序比较器,它是一个弱排序比较器(这就是预期的推力)。错误发生在我提到的那一行上(if(src [i]!= dst [i])) – flip

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也许你应该显示你的'CharArr'结构的定义。您的比较器不能用于订购两个字符串。你应该研究这个来理解它。假设我有两串不等长的字符串传递给比较器。无论我传递字符串的顺序如何,比较器都会返回“false”。因此它不能是一个排序比较器。同样,如果我有两个长度相等的第一个字符不同的字符串,比较器将返回false,无论呈现字符串的顺序如何。它不能是一个排序比较器。 –

回答

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这是行不通的:

thrust::device_vector<CharArr> deviceArrayToSort = hostToSort;// (arrayToSort,arrayToSort + size); 
    thrust::device_vector<long long> deviceArrayToSortRow = hostToSortRow; 

    thrust::stable_sort_by_key(deviceArrayToSort.begin(),deviceArrayToSort.end(),deviceArrayToSortRow.begin(),CharArrayCmp()); 

每个CharArr对象hostToSort包含一个指针点到主机内存位置。当您将该指针复制到设备矢量时,该指针的数值为,不变为。如果您尝试在设备代码中取消引用此(伪造)指针,它将会像您所看到的那样失败。

您将需要经过deviceArrayToSort设备向量,并为它的每个CharArr对象,则需要调整其value指针指向设备存储器的有效位置,这大概也是每个起始地址字符串进行排序。

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哇,使完整和完整的感觉谢谢你的所有帮助。你太棒了 – flip