2012-06-14 63 views
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我希望能够创建带有MultiIndexes的Pandas DataFrame的行和列索引,并从ASCII文本文件中读取它。我的数据是这样的:如何使用MultiIndex从/向ASCII文件写入/读取Pandas DataFrame?

col_indx = MultiIndex.from_tuples([('A', 'B', 'C'), ('A', 'B', 'C2'), ('A', 'B', 'C3'), 
            ('A', 'B2', 'C'), ('A', 'B2', 'C2'), ('A', 'B2', 'C3'), 
            ('A', 'B3', 'C'), ('A', 'B3', 'C2'), ('A', 'B3', 'C3'), 
            ('A2', 'B', 'C'), ('A2', 'B', 'C2'), ('A2', 'B', 'C3'), 
            ('A2', 'B2', 'C'), ('A2', 'B2', 'C2'), ('A2', 'B2', 'C3'), 
            ('A2', 'B3', 'C'), ('A2', 'B3', 'C2'), ('A2', 'B3', 'C3')], 
            names=['one','two','three']) 
row_indx = MultiIndex.from_tuples([(0, 'North', 'M'), 
            (1, 'East', 'F'), 
            (2, 'West', 'M'), 
            (3, 'South', 'M'), 
            (4, 'South', 'F'), 
            (5, 'West', 'F'), 
            (6, 'North', 'M'), 
            (7, 'North', 'M'), 
            (8, 'East', 'F'), 
            (9, 'South', 'M')], 
            names=['n', 'location', 'sex']) 
size=len(row_indx), len(col_indx) 
data = np.random.randint(0,10, size) 
df = DataFrame(data, index=row_indx, columns=col_indx) 
print df 

我试过df.to_csv()read_csv()但他们不保证指数。

我想使用额外的delimeters创建一个新的格式。例如,使用----------------行标记列索引的末尾,并使用|标记行索引的末尾。因此,它应该是这样的:

one   | A A A A A A A A A A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 
two   | B B B B2 B2 B2 B3 B3 B3 B B B B2 B2 B2 B3 B3 B3 
three   | C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 
-------------------------------------------------------------------------------------- 
n location sex :                  
0 North M | 2 3 9 1 0 6 5 9 5 9 4 4 0 9 6 2 6 1 
1 East  F | 6 2 9 2 7 0 0 3 7 4 8 1 3 2 1 7 7 5 
2 West  M | 5 8 9 7 6 0 3 0 2 5 0 3 9 6 7 3 4 9 
3 South M | 6 2 3 6 4 0 4 0 1 9 3 6 2 1 0 6 9 3 
4 South F | 9 6 0 0 6 1 7 0 8 1 7 6 2 0 8 1 5 3 
5 West  F | 7 9 7 8 2 0 4 3 8 9 0 3 4 9 2 5 1 7 
6 North M | 3 3 5 7 9 4 2 6 3 2 7 5 5 5 6 4 2 9 
7 North M | 7 4 8 6 8 4 5 7 9 0 2 9 1 9 7 9 5 6 
8 East  F | 1 6 5 3 6 4 6 9 6 9 2 4 2 9 8 4 2 4 
9 South M | 9 6 6 1 3 1 3 5 7 4 8 6 7 7 8 9 2 3 

大熊猫是否有办法写入/读取从ASCII文件DataFrames到/与MultiIndexes?

+0

是的,只需将multi_sparse设置为False! :) –

回答

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不知道你所使用的大熊猫的版本,但与0.7.3您可以DataFrame导出到TSV文件,并通过这样做保留指数:

df.to_csv('mydf.tsv', sep='\t') 

需要导出到TSV与CSV原因是因为列标题中有,个字符。这应该解决你的问题的第一部分。

第二部分有点棘手,因为据我所知,您需要预先了解您希望DataFrame包含的内容。特别是,你需要知道:

  1. 哪个对你TSV列代表一行MultiIndex
  2. 和列的其余部分也应转换为MultiIndex

为了说明这一点,让读回我们上面保存到一个新的DataFrame TSV文件:

In [1]: t_df = read_table('mydf.tsv', index_col=[0,1,2]) 
In [2]: all(t_df.index == df.index) 
Out[2]: True 

所以我们设法读mydf.tsv变成DataFrame,其具有与原始df相同的行索引。但是:

In [3]: all(t_df.columns == df.columns) 
Out[3]: False 

这里的原因是因为大熊猫(据我可以告诉)没有正确地分析标题行成MultiIndex的方式。正如我上面提到的,如果你知道beorehand您的TSV文件头表示MultiIndex,那么你可以执行以下操作来解决这个问题:

In [4]: from ast import literal_eval 
In [5]: t_df.columns = MultiIndex.from_tuples(t_df.columns.map(literal_eval).tolist(), 
               names=['one','two','three']) 
In [6]: all(t_df.columns == df.columns) 
Out[6]: True 
+0

我喜欢你想出的东西。我想我仍然会创建自己的格式,因为我事先不知道该索引有多少列。谢谢。 – dailyglen

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可以更改打印选项使用set_option

display.multi_sparse
: boolean
   默认True “sparsify” MultiIndex显示
   (不显示重复外水平 元件组内)

现在,作为所希望的数据帧将被打印:

In [11]: pd.set_option('multi_sparse', False) 

In [12]: df 
Out[12]: 
one    A A A A A A A A A A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 A2 
two    B B B B2 B2 B2 B3 B3 B3 B B B B2 B2 B2 B3 B3 B3 
three   C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 C C2 C3 
n location sex                  
0 North M 2 1 6 4 6 4 7 1 1 0 4 3 9 2 0 0 6 4 
1 East  F 3 5 5 6 4 8 0 3 2 3 9 8 1 6 7 4 7 2 
2 West  M 7 9 3 5 0 1 2 8 1 6 0 7 9 9 3 2 2 4 
3 South M 1 0 0 3 5 7 7 0 9 3 0 3 3 6 8 3 6 1 
4 South F 8 0 0 7 3 8 0 8 0 5 5 6 0 0 0 1 8 7 
5 West  F 6 5 9 4 7 2 5 6 1 2 9 4 7 5 5 4 3 6 
6 North M 3 3 0 1 1 3 6 3 8 6 4 1 0 5 5 5 4 9 
7 North M 0 4 9 8 5 7 7 0 5 8 4 1 5 7 6 3 6 8 
8 East  F 5 6 2 7 0 6 2 7 1 2 0 5 6 1 4 8 0 3 
9 South M 1 2 0 6 9 7 5 3 3 8 7 6 0 5 4 3 5 9 

注:在老年熊猫版本,这是pd.set_printoptions(multi_sparse=False)

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