检查已安装版本的R软件包并更新旧版本

我们通过puppet管理集群中的R软件包，并创建了一个文件，其中包含如下所示的命令。我们在内部有R包回购的镜像。检查已安装版本的R软件包并更新旧版本

install.packages（ “BH”，回购= NULL，依赖性= TRUE，contriburl = http://our_internal_repo.com）

在rPackages.xt

此使用木偶我们经由RSCRIPT rPackages.txt

执行

现在在下周我们会获得3个额外的软件包，我们修改rPackages以包含用于新软件包的额外行。

现在由于scirpt会从头到尾读取，它会尝试重新安装所有软件包。

我的问题是，如何安装包只有安装的版本不一样我们的内部回购的一个存在。

如何在RScript中执行这些检查并相应地执行puppet。

管理R安装的最佳实践是什么？

感谢

'help（update.packages）'是你的朋友。 –

在Rstudio中，您只需按下按钮，但最好遵循Dirk的建议。 – user1436187

更改RSCRIPT到

if("BH" %in% rownames(installed.packages()) == FALSE) {install.packages("BH")}

为版本，你很可能packageVersion莫名其妙。

2014-01-24 06:33:23 JeremyS

回答