修改dicom图像并将其保存为原始数据？

这里是我正在尝试修改dicom图像像素的matlab数据。修改dicom图像并将其保存为原始数据？

dicom图像是4D，3d为Rgb图像，其他维度代表fames。我采取每一帧，我修改了一些特定的像素值，我尝试以原始格式保存整个dicom图像数据。

我将它保存为原始格式的原因是我想在dcmtk的dcmodify命令中将此数据用作文件。所以，我的第一个问题是，我是否以正确的格式保存原始数据？如果没有，请告诉我应该怎么做。此外，你知道dcmodify命令dcmtk是否可以像这种情况下处理4d数据，或者它只能修改一个单帧？谢谢。

clc 
clear all 
close all 
img=dicomread('Bad001_2CH_01_anon.dcm'); 
%%implay(img); 
[rows,columns,colors,frames]=size(img); 
for i=1:frames 
    img(1:25,:,:,i)=0; 
    disp(i); 
    figure(1) 
    imshow(img(:,:,:,i)) 
end 
fid=fopen('image.raw','w+'); 
cnt=fwrite(fid,img,'uint8'); 
fclose(fid);

来源

2013-02-21 the_naive

你可能想看看gdcmimg和或gdcmraw取决于你真正想做的事

来源

2013-02-27 15:34:53 malat

感谢您所说的话，它对于单帧dicom图像已经非常有用，但是我还没有设法使用多帧图像。 – 2013-02-28 15:54:27

您可能希望在gdcmraw和/或gdcmimg之前运行第一个'gdcmconv --raw'。 – malat 2013-03-01 10:46:11

你不需要原始数据使用DMTK：“dcmodify is a tool that allows to modify, insert and delete tags and items in DICOM files.”

此外，原始数据是极少数和特定情况下理想的，因为该文件中的一些元数据说的是在那里，当程序读取信息时，它的存储方式会有很大的帮助。

我从来没有用过dmkt，但我猜你应该读与dicomread的数据（如你这样做），修改（如你这样做），然后将其与dicomwrite

要重新保存为DICOM保留DICOM中的元数据，您还需要使用dicominfo来提取元数据，以便在保存文件时将其放回原处。

img = dicomread('originalfile.dcm'); 
metadata = dicominfo('originalfile.dcm'); 

% do something with the img 

% save altered DICOM with metadata 
dicomwrite(img, 'processedFile.dcm', metadata, 'CreateMode', 'copy');

然后，您可以拨打：

dcmodify [options] writtenDicomFile

其中writtenDicomFile是您用于保存文件的名称，并在[选项]指定你怎么改变文件。

来源

2013-02-21 14:14:16 fuyas

以何种格式应我保存数据？ – 2013-02-21 14:26:10

我把它作为原始数据是因为文档中提到“-if --insert-from-file： dcmodify -if”PixelData = pixel.raw“file.dcm 插入文件'pixel.raw'的内容到'file.dcm'的PixelData元素，文件的内容将按原样读取。 OW数据预计是小尾数排序，如有必要将会被交换。不会进行检查以确保数据量在其他属性方面是合理的，如行或列。 “ – 2013-02-21 14:29:55

”如果可能，请亲切地说出我应该如何继续处理此问题。 – 2013-02-21 14:35:40

修改dicom图像并将其保存为原始数据？

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