将原始数据保存为tif

我需要分析tif文件中选定为子矩阵的图像的一部分。我想以原始格式显示图像，没有装饰（缩放，轴，标签等）......我怎么能这样做？将原始数据保存为tif

这是我现在使用的代码：

submatrix = im[x_min:x_max, y_min:y_max] 
plt.imshow(submatrix) 
plt.savefig("subplot_%03i_%03i.tif" % (index, peak_number), format = "tif")

来源

2013-10-30 albus_c

我猜想'plt'是'matplotlib.pyplot'。 –

有可能是有用的[这里]（http://stackoverflow.com/questions/8218608/scipy-savefig-without-frames-axes-only-content） –

可能重复的[Matplotlib情节：去除轴，传说和空白]（http://stackoverflow.com/questions/9295026/matplotlib-plots-removing-axis-legends-and-white-spaces） –

首先，如果你只是想存储原始值或原始值的灰度表现，这是最简单的只使用PIL进行这个。

例如，这将产生一个10×10灰度TIF文件：

import numpy as np 
import Image 

data = np.random.randint(0, 255, (10,10)).astype(np.uint8) 
im = Image.fromarray(data) 
im.save('test.tif')

至于你为什么在matplotlib版本有更多的像素问题，那是因为你implictly告诉它。 Matplotlib数字有一个尺寸（以英寸为单位）和一个dpi（默认情况下，屏幕上显示80，保存时显示100）。此外，默认imshow将插值数组中的值，即使将插值设置为最接近，保存的图像仍然是您为该图指定的大小。

如果你想使用matplotlib保存在一个价值对一个像素的数字（例如，以方便使用色彩映射的），做一些与此类似：

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 

dpi = 80 # Arbitrary. The number of pixels in the image will always be identical 
data = np.random.random((10, 10)) 

height, width = np.array(data.shape, dtype=float)/dpi 

fig = plt.figure(figsize=(width, height), dpi=dpi) 
ax = fig.add_axes([0, 0, 1, 1]) 
ax.axis('off') 

ax.imshow(data, interpolation='none') 
fig.savefig('test.tif', dpi=dpi)

来源

2013-10-31 00:46:38

我做了由Joe建议的更改，我得到以下错误：“ValueError：太多值解包”高度，宽度= np.array（data.shape，dtype = float）/ dpi。我应该改变什么？ –

@albus_c - 这听起来像你有一个3D数组？ “data.shape”看起来像什么？如果它是一个3D数组，你会想要做一些像'height，width，nbands = ...'。 –

@albus_c - 另外，如果你正在处理多波段图像，直接使用'Image'（a.k.a.“PIL”）将它保存为tif。我假设你想根据色彩图（也可以用PIL来完成，也就是用PIL来完成单色图像的着色，但构建色彩图更困难）。 –

将原始数据保存为tif

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