只着色特定像素

Question

我有一个矩阵表示每个（i，j）位置的值都在0和1之间的大脑图像。我正在应用一个彩色图，使得值为1的像素为红色且为0是黄色的，介于两者之间的是中间值。现在，我想要的是，具有0.8以上值的那些像素根据颜色映射获得颜色，并且其余的颜色变得透明（即它们没有获得任何颜色），以便我可以将该图像与另一个大脑图像叠加并且识别高活动区域。我该怎么做呢 ？

我有这样

图片我想只有亮黄色的部分，这样我可以与其他图像重叠，并得到这样的事情。

编辑：

我接着Jigg建议的方法，但最近观察到最终图像旋转和翻转，任何想法，为什么？

Answer 1

这是另一种选择，创建一个复制灰度大脑图像的3层阵列（imagesc将按比例缩放每个图层，导致相等的r，g和b值 - >灰度级别）。

GrayBckgnd = repmat(brain, [1, 1, 3]); 
data = … 

然后与活动数据覆盖它：

imagesc(GrayBcknd); 
hold on; 
DataImg = imagesc(data); 
set(DataImg, 'AlphaData', im2double(data>0.8)); 
colormap jet; % or any other colormap. 

Answer 2

您可以通过绘制一个surf（-ace）并按如下方式传递alpha值来完成此操作。

brain = ... % background brain image 
data = ... % the data you are trying to overlay 
imshow(brain); 
hold on; 
surf(zeros(size(data)), data, 'AlphaData', data > 0.8); 
colormap(...); % whatever colormap you like 

看一看在surface properties文档，更多的选项，你可以传递给surf。