PBS集群上的MPI Hello World

我正在使用mpiexec来运行两个hello world可执行文件。它们每个都运行，但进程数总是1，看起来应该有4个进程。有人明白为什么吗？我也不确定stty为什么给我一个无效的论点。谢谢！PBS集群上的MPI Hello World

这里是输出：

/bin/stty: standard input: invalid argument 
    Hello world from process 0 of 1 
    Hello world from process 0 of 1 
    Hello world from process 0 of 1 
    Hello world from process 0 of 1

这里是C文件：

#include <stdio.h> 
#include <mpi.h> 

int main(int argc, char *argv[]) 
{ 
    int rank, size; 
    MPI_Init (&argc, &argv); 
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); 
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size); 
    printf("Hello world from process %d of %d\n", rank, size); 
    fflush(stdout); 
    MPI_Finalize(); 
    return 0; 
}

这里提交脚本：

#!/bin/bash 

#PBS -N helloWorld 
#PBS -l select=4:ncpus=2 
#PBS -j oe 
#PBS -o output 
#PBS -l walltime=3:00 
cd $PBS_O_WORKDIR 


mpiexec ./helloWorld

来源

2010-10-10 Steven Wexler

[MPI \ _Rank返回所有进程的相同进程号的可能重复]（http://stackoverflow.com/questions/20287564/mpi-rank-return-same-process-number-for-all-process） – 2014-06-16 15:32:44

史蒂芬：

以上应该管用;它看起来像沿线（PBS < - > MPI库< - > mpiexec）是错误配置。

首先，最明显的猜测是mpiexec是与你编译的库相对应的mpi启动程序。如果在脚本中执行which mpiexec，那么在编译该程序时是否获得与which mpicc相对应的内容？在编译之前，你是否必须像“模块加载[mpi包]”一样做任何事情？

同样，您的mpiexec PBS感知？如果没有，你可能不得不指定一个主机文件（$ {PBS_NODEFILE}）和处理器的数量。

你正在使用什么mpi，以及你在运行什么系统 - 它是一个公开可用的系统，包含我们可以查看的文档？

来源

2010-10-10 16:44:55

当我运行mpiexec mpicc时，我得到/ usr/bin/mpicc/usr/bin/mpiexec。这看起来不错。我不确定什么是“模块负载”。我猜我没有？我认为问题可能是我的mpiexec不知道PBS。但是，我不确定如何指定主机文件。我运行的系统是私人的，但手册页指向该网站的文档：http://www.mcs.anl.gov/mpi/www – 2010-10-11 18:16:47

好的。模块加载内容通常用于安装有多个MPI的大型计算站点;如果你需要使用它，你会了解它。如果您使用的是OpenMPI（mpiexec -V将提供版本信息），则语法为'mpiexec -np 8 --hostfile $ PBS_NODEFILE。/ helloWorld'。如果你使用MPICH2（mpich2version会给你一些信息），语法应该是'mpiexec -f $ PBS_NODEFILE -np 8。/ helloWorld'。看看其中的哪一个能给出更好的结果。 – 2010-10-11 19:14:07

当运行mpiexec -version我得到：版本0.83，配置选项：'--prefix =/usr''--with-default-comm = mpich2-pmi''--with-pbs =/usr/pbs'配置选项：'--prefix =/usr''--with-default-comm = mpich2-pmi''--with-pbs =/usr/pbs' （当我运行mpiexec -V时或mpich2version我什么都没得到-V不是一个可识别的标签mpich2version命令没有找到当我找到mpich2version我什么也没有得到）这两个命令都没有正确的语法。另外，当我回显$ PBS_NODEFILE时，我什么都没有。我不确定我应该得到什么。 – 2010-10-11 19:43:55

PBS集群上的MPI Hello World

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