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发送阵列PBS脚本

我有一个bash脚本，与几个变量调用qsub： group=group_1 normals=$(IFS=,; echo *.txt) qsub -v VAR1=$group,VAR2=${normals[@]} [...] run_script.pbs run_script.pbs #PBS -l nodes=1:ppn=16 #PBS -l walltime=2:00:00 #PB

bash pbs 2017-09-13

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grep qstat输出和复制文件一旦完成

我在我的群集上使用PBS作业调度程序。在bash，我想监视作业状态，一旦工作完成，我想复制结果到 特定位置（/数据/ MyFolder中/） 我qstat命令输出如下： JobID Username Queue Jobname SessID NDS TSK Memory Time Status -----------------------------------------------

bash cluster-computing pbs 2017-06-14

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将SLURM批处理命令行参数传递给R

我试图运行带有各种参数的SLURM sbatch命令，这些参数可以在R脚本中读取。当使用PBS系统时，我曾经写过qsub -v param1=x,param2=y（+其他系统参数，如内存要求等，以及由PBS读取的脚本名称），然后在R脚本中用x = Sys.getenv(‘param1’)读取它。 现在我试图 sbatch run.sh --export=basePath=‘a’ 随着run.s

r cluster-computing distributed-computing pbs slurm 2017-08-09

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从PBS作业中调用python脚本

如何调用python脚本以从pbs作业运行？ 更多的细节： 我目前有以下形状的PBS文件的工作（这部分完美的作品，不应该被改变）： #!/bin/bash #PBS -N # work name #PBS -q #PBS -l #PBS -S /bin/bash #PBS -m ##PBS -M #my email cd $PBS_O_WORKDIR 我有那么上面的计算中完成一个

python bash delay pbs qsub 2017-08-10

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扭矩安装错误：@ SBINDIR @/trqauthd：没有这样的文件或目录

我给下面的命令来安装（以root登录）的扭矩： ./configure make make install 在那之后，我尝试使用运行转矩守护： cp contrib/init.d/trqauthd.in /etc/init.d/trqauthd chkconfig --add trqauthd echo /usr/local/lib > /etc/ld.so.conf.d/torque

batch-processing job-scheduling pbs rhel6 torque 2017-08-10

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如何设置默认应用程序以打开日志文件，尽管更改文件结尾（在MobaXterm中）？

如果文件结尾不断变化，是否有方法可以为这些日志文件设置默认应用程序，即使是 ？ 我工作的MobaXterm，并通过* .pbs运行一些代码文件后，我得到的形式错误和输出日志文件： sample_code.o23456 sample_code.e23456 当我打开日志文件我我被要求设置一个默认的应用程序，并选择一个应用程序来打开日志文件。 下一次我执行它的文件结尾将有改变 sample_co

python windows logging ssh pbs 2017-06-22

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PBS批量作业提交

我有100个带.bash扩展名的脚本，我想在pbs脚本中一次性提交所有这些脚本。我用 qsub * .bash 但它不工作。任何人都可以请帮我

pbs 2017-08-15

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链接阵列PBS作业

我试图使用PBS高性能计算机作业调度器来链接两个计算作业。我的脚本如下： 调用的脚本1.pbs： #!/bin/bash #PBS -N 1 #PBS -q thin #PBS -l walltime=0:03:00 #PBS -l select=1:ncpus=1 #PBS -j oe #PBS -J 1-10 cd $PBS_O_WORKDIR echo 'SCRIPT 1'

arrays bash hpc qsub pbs 2017-06-28

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乔布斯从运行状态进入排队和回

开关我们与转矩PBS和毛伊岛的群集上一些工作观察这个奇怪的现象：一些作业（R）unning和（Q）ueued状态之间切换。尝试谷歌周围，并没有发现任何提示。可能是什么原因？值得注意的是，这些作业的性质不同：有些使用TensorFlow和python，另一些使用C++可执行文件。

cluster-computing pbs torque 2017-06-30

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Bash脚本和命令行参数

所以我有一个名为“run_correlation_study.pbs”和“correlation_study.pbs”的文件。在correlation_study.pbs中，我运行一个使用便携式批处理软件（pbs）的bash脚本并分配3个命令行参数，这些参数将用于我的实际程序中。在run_correlation_study.pbs中，循环遍历在correlation_study.pbs中使用的命令

c++ bash pbs 2017-07-12

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