ImageJ - 图像在批处理堆栈

Question

我有.tiff文件，每个文件包含25个堆栈的各个部分。有没有办法可以批量使用“Image to Stack”命令？每个数据集包含所有三个颜色通道的60个tiff。

感谢 恭

Answer 1

的一般方法，以发现如何做这些事情是使用宏录制，您可以Plugins > Macros > Record ...下找到。如果你然后去File > Import > Image Sequence...和次序选择正常的第一个文件，你应该看到以下出现在记录是这样的：

run("Image Sequence...", "open=[/home/mark/a/1.tif] number=60 starting=1 increment=1 scale=100 file=[] or=[] sort"); 

为了让这对切片的任意数量的工作（我的例子发生有60）只是省略了number=60位。因此，例如，要将此文件目录从命令行转换为单个文件，您可以执行以下操作：

imagej -eval 'run("Image Sequence...", "open=[/home/mark/a/1.tif] starting=1 increment=1 scale=100 file=[] or=[] sort"); saveAs("Tiff", "/home/mark/stack.tif");' -batch