我有一个名为n_groups
的灯具,我想在某些情况下进行参数化,但在其他情况下不能。原因是因为我的MVC类数据模型的构造方式,我尽可能在“模型”类中进行测试,但“控制器”类不需要进行广泛的测试,因为我已经在“模型”中完成。因此,在控制器中运行所有参数化测试是多余的,我想限制测试的次数以及测试时间。目前,为了测试我的控制器的初始化,生成了超过18,000个测试,运行需要42分钟!请参阅Travis-CI output。在pytest的不同测试中只使用某些灯具参数化
目前,我的解决方法是做,
# Contents of conftest.py
import pytest
import pandas as pd
import numpy as np
@pytest.fixture(scope='module', params=[2, 3],
ids=['2_groups', '3_groups'])
def n_groups(request):
"""Number of phenotype groups.
For testing that functions work when there's only 2 groups
"""
return request.param
@pytest.fixture(scope='module')
def n_groups_fixed():
"""Fixed number of phenotype groups (3)"""
return 3
然后,我通过其中n_groups
或n_groups_fixed
到测试创建数据灯具的下一个链。 outliers
,pooled
,samples
,n_samples
和metadata_phenotype_col
固定装置也被参数化,但超出了这个问题的范围。
# Contents of conftest.py
@pytest.fixture(scope='module')
def groups(n_groups):
"""Phenotype group names"""
return ['group{}'.format(i + 1) for i in np.arange(n_groups)]
@pytest.fixture(scope='module')
def groups_fixed(n_groups_fixed):
"""Phenotype group names"""
return ['group{}'.format(i + 1) for i in np.arange(n_groups_fixed)]
@pytest.fixture(scope='module')
def groupby(groups, samples):
return dict((sample, np.random.choice(groups)) for sample in samples)
@pytest.fixture(scope='module')
def groupby_fixed(groups_fixed, samples):
return dict((sample, np.random.choice(groups_fixed)) for sample in samples)
@pytest.fixture(scope='module')
def metadata_data(groupby, outliers, pooled, samples,
n_samples,
metadata_phenotype_col):
df = pd.DataFrame(index=samples)
if outliers is not None:
df['outlier'] = df.index.isin(outliers)
if pooled is not None:
df['pooled'] = df.index.isin(pooled)
df[metadata_phenotype_col] = groupby
df['subset1'] = np.random.choice([True, False], size=n_samples)
return df
@pytest.fixture(scope='module')
def metadata_data_groups_fixed(groupby_fixed, outliers, pooled, samples,
n_samples,
metadata_phenotype_col):
df = pd.DataFrame(index=samples)
if outliers is not None:
df['outlier'] = df.index.isin(outliers)
if pooled is not None:
df['pooled'] = df.index.isin(pooled)
df[metadata_phenotype_col] = groupby_fixed
df['subset1'] = np.random.choice([True, False], size=n_samples)
return df
似乎相当麻烦有*_fixed
版本这些灯具。
测试的实例将是数据模型中测试的n_groups
两个参数化内的广泛的测试,和控制器,它仅测试一个“参数化”使用groups_fixed
内的更少广泛试验(这些是不是真正的试验,只是示范示例):
# Contents of test_model.py
class TestModel(object):
def test__init(metadata_data, ...):
...
def test_plot(metadata_data_fixed, ...);
...
# Contents of test_controller.py
class TestController(object):
def test__init(metadata_data_fixed, ...):
...
是否有另一种方法可以做到这一点?我已阅读pytest的parameterize文档,但似乎只是在全局范围内设置参数,而不是按照每个测试。
我想这样做:
# Contents of test_model.py
class TestModel(object):
def test__init(metadata_data, ...):
...
@pytest.mark.parameterize(n_groups=3)
def test_plot(metadata_data, ...);
...
# Contents of test_controller.py
class TestController(object):
@pytest.mark.parameterize(n_groups=3)
def test__init(metadata_data_fixed, ...):
...
UPDATE:内TestController
添加一个n_groups
夹具没有帮助,即这不起作用:
# Contents of test_controller.py
class TestController(object):
@pytest.fixture
def n_groups():
return 3
def test__init(metadata_data_fixed, ...):
...
我不知道为什么,因为看起来这个夹具应该覆盖全球n_groups
定义在conftest.py
谢谢!这适用于'TestController',因为我可以在'test_controller.py'文件中找到它,并且将应用于文件中的所有测试。对于'TestModel',我会考虑检查'metafunc.function .__ name__'来检查吗?看起来这种东西可以封装在一个装饰器中用于测试功能。你知道这样的功能是否计划在'pytest'中吗? –
是的,检查metafunc.function .__ name__会起作用。不过,我不认为有任何计划将其作为内置装饰器来实现。 –