从R运行jar时rJava NoSuchFileException

我试图从R运行使用rJava软件包的可运行JAR文件。这个罐子有写入和读取一些文件到/从外部文件夹，这是在为JAR文件本身相同的路径，像这样：从R运行jar时rJava NoSuchFileException

mypath/myjar.jar 
mypath/folder1 
mypath/folder2 
mypath/input_file1.txt 
mypath/input_file2.txt

程序工作正常，如果我在打开一个控制台叫它“mypath中”运行罐子方式如下：

java -jar myjar.jar input_file1.txt input_file2.txt false

但是当我尝试运行在读该代码，使用rJava，代码崩溃在某些时候，因为它不能找到既mypath中/资料夹，也不mypath/folder2，即使工作目录被正确定义为“mypath”。

jinit(".",force.init=TRUE) # this starts the JVM 
.jaddClassPath("myjar.jar") 
jobject <- .jnew("package_name/Main") ## call the constructor 

result_java <- rJava::.jcall(obj = jobject, returnSig = "V", method = "main", c("input_file1.txt","input_file2.txt","false"))

事实上，Java程序被调用，它是能够真正找到输入文件，这也是mypath中，但由于某种原因崩溃时，它尝试写入文件夹mypath中（如文件夹1和文件夹2）与错误：

Error executing task java.nio.file.NoSuchFileException: folder1/some_file.txt

我真的不知道发生了什么事，花了几个小时这一点。我在这里错过了非常明显的东西吗？

来源

2017-09-30 Mr. Phil

当您使用Java运行代码时，您位于mypath之内，并且您的代码可以看到folder1和folder2的位置。

也许，你应该传递（作为参数）目录的位置，而不是访问你的Java代码中的folder1，你应该访问显式路径。

result_java <- 
    rJava::.jcall(
    obj = jobject, 
    returnSig = "V", 
    method = "main", 
     c( 
     "input_file1.txt", 
     "input_file2.txt", 
     "false", 
     "full_path_to_your_mypath_location"))

然后，里面main，你可以简单地打开full_path_to_your_mypath_location/some_file.txt。当你启动R时，你可能不再在你的代码的目录中。您也可以尝试更改目录

setwd(full_path_to_your_mypath_location)

来源

2017-10-02 06:48:29 mko

从R运行jar时rJava NoSuchFileException

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