2017-08-18 39 views
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我DF:在大熊猫一个数据帧的丢失样本

In [163]: df.head() 
Out[163]: 
         x-axis y-axis z-axis 
time 
2017-07-27 06:23:08 -0.107666 -0.068848 0.963623 
2017-07-27 06:23:08 -0.105225 -0.070068 0.963867 
..... 

我设置索引日期时间。由于采样率(10赫兹)在数据帧中并不总是恒定的,并且对于某些秒我有8或9个采样。

  1. 我想在我的DATATIME指定毫秒(6时23分08秒**。** 100,6时23分08秒**。** 200等)
  2. 我也要喜欢做缺失样本的插值。

一些想法如何做到这一点的熊猫吗?

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我只看到相同的时间戳两行。如果我们要以'100ms'或'10 Hz'的频率对数据帧进行重新索引,我们只需将同一秒内的所有行集中到相应的第一个十分之一秒。剩下的9分十秒将是空的。您的数据必须包含小数秒的信息,否则此练习将失败。请提供小数秒的示例数据。 – piRSquared

回答

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首先,让我们创建这可能类似于您的数据的一些样本数据。

import pandas as pd 
from datetime import timedelta 
from datetime import datetime 

base = datetime.now() 
date_list = [base - timedelta(days=x) for x in range(0, 2)] 
values = [v for v in range(2)] 
df = pd.DataFrame.from_dict({'Date': date_list, 'values': values}) 

df = df.set_index('Date') 
df 

          values 
Date  
2017-08-18 20:42:08.563878 0 
2017-08-17 20:42:08.563878 1 

现在我们将创建另一个数据帧与每100毫秒的数据点。

min_val = df.index.min() 
max_val = df.index.max() 

all_val = [] 
while min_val <= max_val: 
    all_val.append(min_val) 
    min_val += timedelta(milliseconds=100) 
# len(all_val) 864001 
df_new = pd.DataFrame.from_dict({'Date': all_val}) 
df_new = df_new.set_index('Date') 

让我们连接两个数据框,以便所有缺少的行都有索引但没有值。

final_df = df_new.join(df) 
final_df 

          values 
Date  
2017-08-17 20:42:08.563878 1.0 
2017-08-17 20:42:08.663878 NaN 
2017-08-17 20:42:08.763878 NaN 
2017-08-17 20:42:08.863878 NaN 
2017-08-17 20:42:08.963878 NaN 
2017-08-17 20:42:09.063878 NaN 
2017-08-17 20:42:09.163878 NaN 

现在插值数据:

df_final.interpolate() 

          values 
Date  
2017-08-17 20:42:08.563878 1.000000 
2017-08-17 20:42:08.663878 0.999999 
2017-08-17 20:42:08.763878 0.999998 
2017-08-17 20:42:08.863878 0.999997 
2017-08-17 20:42:08.963878 0.999995 
2017-08-17 20:42:09.063878 0.999994 
2017-08-17 20:42:09.163878 0.999993 
2017-08-17 20:42:09.263878 0.999992 

一些插值策略:https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/generated/pandas.DataFrame.interpolate.html

更新:根据中和意见的讨论:

说我们的初步数据没有毫秒的信息。

df_new_date_without_miliseconds = df_new['Date'] 
df_new_date_without_miliseconds[0] # Timestamp('2017-08-17 21:45:49') 

max_value_date = df_new_date_without_miliseconds[0] 
max_value_miliseconds = df_new_date_without_miliseconds[0] 

updated_dates = [] 
for val in df_new_date_without_miliseconds: 
    if val == max_value_date: 
     val = max_value_miliseconds + timedelta(milliseconds=100) 
     max_value_miliseconds = val 
    elif val > max_value_date: 
     max_value_date = val + timedelta(milliseconds=0) 
     max_value_miliseconds = val 
    updated_dates.append(val) 

output: 

[Timestamp('2017-08-17 21:45:49.100000'), 
Timestamp('2017-08-17 21:45:49.200000'), 
Timestamp('2017-08-17 21:45:49.300000'), 
Timestamp('2017-08-17 21:45:50'), 
Timestamp('2017-08-17 21:45:50.100000'), 

分配新值数据框

df_new['Date'] = updated_dates 
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感谢插值和加入的想法。我的DF的问题是我每秒有10个样本,但不是时间的规格,所以以毫秒为单位。因此,我有10个数据具有相同的时间戳,我无法加入新的df_new。我想我应该先将毫秒添加到我的原始df中,然后再将它添加到df_new中。但我不知道该怎么做。任何想法? –

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您可以随机将100 * n毫秒添加到每个数据点。但这不会给你正确的数据顺序。要点是如果你的原始数据没有毫秒,那么通过随机产生毫秒来产生错误的数据。 –

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@EmanuelaLiaci更新了代码以将毫秒信息添加到数据框。 –