剖析R中

我试图追查为什么一个包我已经把加载缓慢的原因（S）（相对于其他人，这是明显慢），并运行此功能“图书馆”（使用ggplot2作为一个例子）似乎并没有给任何见解：剖析R中

Rprof(line.profiling=TRUE) 
library(ggplot2) 
Rprof(NULL) 
summaryRprof("Rprof.out", lines = "show")

这将产生：

$by.self 
       self.time self.pct total.time total.pct 
<no location>  0.5  100  0.5  100 
$by.total 
       total.time total.pct self.time self.pct 
<no location>  0.5  100  0.5  100 
$by.line 
       self.time self.pct total.time total.pct 
<no location>  0.5  100  0.5  100 

$sample.interval 
[1] 0.02 

$sampling.time 
[1] 0.5

（和Rprof.out包含的我无法理解信息的混乱）

任何人都可以建议我如何“简介”功能library正在做什么？或者，我采取了错误的方法？

来源

2014-01-16 Andy Barbour

要清楚，我肯定不是暗示'ggplot2'加载缓慢。 –

我可能会提供一些猜测，如果你指出你的软件包的源代码。我会看看你在NAMESPACE中做了什么，你的包环境中有多少个对象，等等。 – hadley

谢谢@hadley。我敢肯定，你有更好的事情要做，但代码库是在这里：https://github.com/abarbour/strain –

，因为它说在?summaryRprof的线谱部分：

如果代码正在运行已源的参考信息保持（通过 keep.source = TRUE在source或KeepSource = TRUE在封装 DESCRIPTION文件或某种其它那么在剖析期间记录关于线的起源的信息。

默认情况下，构建/安装软件包时不保留源代码。如果您只运行summaryRprof()，您将看到非平凡的计时。你总是可以用KeepSource=TRUE重新安装基础包，但这可能比它的价值更麻烦。

另一种替代方法是使用debugonce(library)逐行呼叫library呼叫。这有点蛮力，但它可能比梳理profiling输出更明显。

来源

2014-01-16 22:46:55

有趣的点。为了澄清，当你写“基础包”时，你的意思是我正在学习的包，还是'base'包，以便'library'的源代码被保留？ –

@AndyBarbour：后者。 –

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