store.root.attributes not saving - 熊猫和Pytables

因此，我将数据文件解析为熊猫数据框，然后使用HDFStore将文件保存到hdf5。代码：store.root.attributes not saving - 熊猫和Pytables

def convert_folder_hdf5(folder, save_loc=None): 
    if save_loc is None: 
     save_loc = folder 

    filename = save_loc+'\\' + (folder.split('\\')[-1])+'.h5' 
    store = pd.HDFStore(filename, format="table", complevel=9, complib='blosc') 
    data = import_folder(folder) 

    if data['voltage recording'] is not None: 
     store['voltage_recording'] = data['voltage recording'] 
    if data['linescan'] is not None: 
     store['linescan'] = data['linescan'] 

    store.root.attributes = data['file attributes'] 

    store.close()

然而，我去访问store.root.attributes我给出：

tables.exceptions.NoSuchNodeError: group ``/`` does not have a child named ``attributes``

store.root回报（这个特定的文件夹中有没有线扫描文件）：

/ (RootGroup) '' 
    children := ['voltage_recording' (Group)]

只需在控制台中，我可以工作做手工：

store.root.attributes = data['file attributes']

然后，当我打电话给store.root.attributes我得到了我期待得到的。但是，如果我然后重新保存该文件，并重新打开它在store.root.attributes中设置的内容不见了（我得到与上面相同的错误）。

来源

2014-09-13 user3014097

您不能直接存储在节点中，而是直接存储在节点的属性部分中。从here开始，您必须实际创建一个节点并使用.attrs属性来抓取实际存储事物的位置。

这里有一个办法直接做到这一点：

In [16]: store.root._v_attrs.attributes = 'bar' 

In [17]: store.root._v_attrs 
Out[17]: 
/._v_attrs (AttributeSet), 5 attributes: 
    [CLASS := 'GROUP', 
    PYTABLES_FORMAT_VERSION := '2.1', 
    TITLE := '', 
    VERSION := '1.0', 
    attributes := 'bar']

熊猫还在开发一种更通用的API获取/设置属性，随意评论：https://github.com/pydata/pandas/pull/7334

此外，指定format='table'打开时HDFStore被忽略。这仅适用于to_hdf。您无法为整个商店提供格式，只需逐个对象。 http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/io.html#table-format

来源

2014-09-16 15:06:25 Jeff

我有点困惑 - 最近做了些什么改变？我实际上有一个关于这样做的问题，然后您的回复与我在上面的代码示例中的回复相似。请参阅：http://stackoverflow.com/questions/25232707/performancewarning-pandas-and-pytables-cani-i-fix-this – user3014097 2014-09-16 17:01:47

不知道我在想什么。在非根节点上，您*可以*（使用''.attrs''）存储。但这只适用于''store.get_storer（'df'）。attrs''。否则使用上面的方法。 – Jeff 2014-09-16 17:11:39

store.root.attributes not saving - 熊猫和Pytables

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