chemistry

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我绝不是一个数学人，但我真的想弄清楚如何从化学滴定法测量的一些数据图中创建可图示的函数。我一直在努力学习R，我想知道是否有人可以向我解释或指向我创建下面滴定图的数学函数的指南。在此先感谢。

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我想写一个需要两个列表作为输入的python函数：一个包含一些分子SMILES代码和另一个包含分子名称的代码。然后它计算所有分子对之间的TANIMOTO系数（我已经有了这个功能），并分别返回两个新列表，其中所有分子的斯米尔和其他任何其他分子的名字都不高于a一定的阈值。这是我迄今所做的，但它给错误的结果（最让我得到分子几乎是一样的...）： def TanimotoFilter(molist,n

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化学式的分子符号的扩展

我环顾了一下，找出一个解决方案，解析出一个化学分子式，其中含有可能有其自己后缀的分子组分，以便能够解析其完整原子分数的公式。在Java中如何做到这一点？

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可以INCHI用于化学结构的搜索，而不是指纹

我想到用INCHI的主层，电荷层和立体层（INCHI字符串），我们还是可以比较的化学分子结构搜索（相似性和结构搜索），但是，为什么大多数应用都是用于进行相似性搜索或子结构搜索的化学指纹。 INCHI中缺少的可通过化学指纹（如daylight或任何其他指纹）可用的缺失

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如何用化学反应动力学使用optimize.fmin功能在Python 2.7

我有一个任务绘制两个连续的一级反应，然后找到反应B. 我已经成功地绘制出最大浓度这三个函数的图表，我正在努力寻找最大值。我的老师告诉我要使用optimize.fmin() （我想他要我为反应B创建一个负数，并找到该函数的最小值，这应该是最大值。），只有麻烦是它不工作！这是我到目前为止，我已尝试其他值为0.75以外的第二个参数在optimize.fmin()函数。我在哪里错了？我看到错误

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如何在Perl上正确指定这些变量？

我跑了一个分子动力学模拟，给了我2000个轨迹文件。这些文件的文件名格式为au25-c2-benzalacetone.001，最高为2000.我编写了一个普通的perl程序，但它没有读取2000个文件。如何修改我的代码以便它读取每个文件并分别提取每个文件的坐标？我需要2,000 coordinates_of_interest.dat文件。这里的修补程序文件是au25-c2-benzalaceton

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如何使用正则表达式来识别化学公式中氢的数量？

应使用哪种表达式来确定化学式中的氢原子数量？例如： C40H51N11O19 - 51氢 C2HO - 1氢 CO2 - 无氢（空）任何建议？谢谢！干杯！

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如何确定化学反应的优先级？

如果一个容器中有多个化学反应，如何决定这些反应的顺序。例如，有在一个烧杯三种化学品，称为A，B和C的化学A可以与乙反应，并且A可以为C过于反应。是否有任何规则来决定化学反应的优先顺序？

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C中的分子质量计算器程序

我需要做一个计算项目，计算用户输入的任何分子的摩尔质量。例如，如果用户键入CO2，我的程序需要识别C（与质量相关的矩阵），然后确定O（与其质量相关）并将其乘以2，然后将它们相加。我正在考虑为每个元素使用字符串。我在编程方面很新颖，而且我已经非常了解基础知识。你们会如何推荐我这么做？ Im相当失去非常感谢您

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化学信息的API？

我正试图编写一个python脚本来检索我输入的化合物的沸点，熔点，分子量，化学结构和密度。我正在查看数据库，发现chemspipy和PubChemPy，但都没有能力检索我需要的所有属性。我有一个使用书面chemspipy的脚本，即正常工作的一部分： from chemspipy import ChemSpider import urllib cs = ChemSpider('my_to