graph-tool

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    我有以下代码使用属性映射到注释的曲线图: from graph_tool.all import * # define graph g = Graph() g.set_directed(True) species = g.new_vertex_property("string") species_dict = {} reaction_dict = {} #add species a

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    我已经在ubuntu上安装了python2.7的graph-tool工具。我随后安装了Anaconda。当我现在尝试从python内部运行from graph_tool.all import *时,我收到消息ImportError: No module named graph_tool.all。然后,我再次卸载图形工具,并尝试重新安装它,但无济于事。我仍然收到错误ImportError: No m

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    如何设置顶点的背景颜色? 我知道应该有一个属性字典或其他东西,但我找不到示例。 我需要它颜色不同的顶点的二部图中: gtdraw.graph_draw(g, pos=pos, vertex_fill_color=part, vertex_font_size=6, output_size=(5000, 5000), output

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    我开始与图形工具工作,从熊猫数据帧df进口边缘的列表喜欢读书边列表: node1 node2 0 1 2 1 2 3 2 1 4 3 3 1 4 4 3 5 1 5 所以基本上定向列表边缘。我根据与教程导入到图的工具: from graph_tool.all import * import pandas as pd # Read pandas dataf

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    我有一个有向图,我试图找到最前面的k个最短路径。目前,我已经在图形工具中实现了网络,该图形工具提供了一种最短路径算法,但是我没有提供k最短路径算法。我碰到过这个帖子(All shortest paths using graph_tool),但我并不是所有连接两个节点的路径。 看起来好像NetworkX具有为此实现的功能(https://networkx.readthedocs.org/en/sta

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    我目前正在使用模块(图形工具)的当前发行版本(v1.12)。然而,目前正在开发的版本(v1.13)也可以通过Git获得,其中包含一些未在发布版本中实现的功能。我想使用这些函数,但看到,因为我不知道它将如何稳定运行我不确定是否要覆盖当前安装的版本。就我所知,开发版本必须从源代码编译。我知道我可以用一个不同的名称将它导入到python中,只要我编译它并将它安装到我的硬盘驱动器上,但是如何在不覆盖旧版本

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    在OSX 10.10安装graphtool我尝试使用下面的命令来安装graphtool: brew tap homebrew/science brew install graph-tool 的顺利安装完成,但是当我输入graph_tool,我看到下面的“符号未找到”的错误: Python 2.7.10 (default, Jul 14 2015, 19:46:27) [GCC 4.2.1

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    我在Ubuntu上安装了图形工具。当试图将其导入IPython中我得到一个错误: ImportError: No module named graph_tool.all 正如我在其他帖子看有可能是我使用不同版本的Python比我使用的系统版本上安装图形工具。我的问题是现在,我如何检查安装了哪个版本的图形工具,以及如何改变它以便导入它? 感谢您的任何建议!

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    我已经创建了一个图表(graph1.xml),这是我在前面的脚本中保存的。我现在已经加载了这个图表,并试图绘制它。当我键入python2.7(在Ubuntu)以下: load_graph('graph1.xml') 我收到一条消息说: <Graph object, directed, with 10194124 vertices and 25920412 edges at 0x7fbb837a

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    所以我试图生成一个随机有向图,使每个顶点有3个in-nodes和1个outnode。但图形工具似乎陷入了deg_sampler()函数中。 from graph_tool.all import * def deg_sampler(): return 1,2 g = random_graph(1000,deg_sampler,verbose=True) 我得到这个错误运行代码 a