lsf

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我正在使用一个库来生成一整吨输出到stderr（并且真的没有办法直接在代码中抑制输出;它是ROOT的Minuit2最小化工具被称为没有办法抑制输出）。我正在通过LSF系统运行批处理作业，并且错误输出文件太大以至于超过了我的磁盘配额。 ERK。当我在一个shell本地运行，我做的： python main.py 2> >(grep -v Minuit2 2>&1) 抑制输出，为完成here.

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如何在lsf中启动多线程mpi进程？

我想使用LSF提交哪种作业：上4个节点运行时，在平行每个节点具有单个MPI进程每个进程有12个线程在没有LSF的情况下，我只需在4个节点上启动mpi，如： mpirun -hosts host1，host2，host3，host4 -np 4 ./myprocess --numthreads = 12 但是，在LSF的存在下，我看不到如何做到这一点？我相信可能有一个非常标准的方式来做到这一

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如何按提交的时间/作业名称对作业列表进行排序？

在LAVA或LSF中，如何根据提交的时间/作业名称对bjobs命令的输出进行排序？裸bjobs通常会弄得一团糟。我无法在手册中找到正确的选项，例如this one。

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在bash脚本中使用bsub lsf调用bash函数

我有一个bash函数，我想bsub。当我尝试获取脚本时，它被递归地调用，但是如果我不收集脚本，它似乎不会识别我的功能。如何在同一脚本文件中的函数上正确调用besub？ my_script（应打印 “12345”）： #! /bin/sh function myFunct { echo $1 } bsub -q myQueue "source ./my_script; myFunct 12

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Python的重定向从LSF命令输出

我试图用子进程运行LSF命令，“bjobs”一个Python代码内，我无法得到输出到一个变量方面我已经尝试和失败如下： proc = subprocess.Popen(['bjobs'],stdout=subprocess.PIPE) print proc.stdout.read() ## Not working stdout,stderr = subprocess.Popen(['bjo

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是否有向SLURM提交大量工作的“单线”（类似于LSF）？

我可以向SLURM提交“单行证”吗？使用由LSF和标准的Linux工具xargsbsub，我可以很容易地提交单独的作业进行解压缩所有文件的目录中： ls *.gz | sed 's/.gz$//g' | xargs -I {} bsub 'gunzip -c {}.gz > {}' 使用SLURM，我认为srun或sbatch会工作，但无济于事： ls *.gz | sed 's/.gz$/

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在lsf集群上提交mpi作业

我通常在大学的集群上处理数据。以前完成的大部分作业都基于并行批处理外壳（将作业分成几个批次，然后并行提交）。这个外壳的一个例子如下所示： #! /bin/bash #BSUB -J model_0001 #BSUB -o z_output_model_0001.o #BSUB -n 8 #BSUB -e z_output_model_0001.e #BSUB -q general #B

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排序bjobs输出

有没有一种方法来根据submit_time排序bjobs输出？还是根据其他一些领域？ JOBID USER STAT QUEUE FROM_HOST EXEC_HOST JOB_NAME SUBMIT_TIME

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延长USUSP作业的运行时间限制

当我半途中进行计算时，我刚刚发现运行时限制为50:00可能不够。因此，我使用$ bstop 1234来停止作业1234并尝试修改旧的运行时-W 50:00到-W 100：00 您能否建议一个命令来执行此操作？我根据 [-W [hour:]minute[/host_name | /host_model] | -Wn] 试图 $ bmod -W 100:00 1234 Please reque

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SLURM显示未完成作业的stdout和stderr

我曾经使用LSF服务器，但现在我只是转换到SLURM服务器。 SLURM中bpeek（用于LSF）的等效命令是什么？ bpeek bpeek显示未完成作业的输出和错误输出我找不到任何地方的文档。如果你对SLURM有一些很好的参考，请让我知道。谢谢！