openmpi

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我在HPC上运行doMPI，我想记录来自工人的输出。使用doParallel，我可以使用makeCluster(outfile='myfile.log')。使用doMPI，在任何方法中似乎都不存在任何参数。我尝试使用sinkWorkerOutput()。这是有效的，但只为其中一名工作人员写了日志。我怀疑每个工人都在重写另一个工人。 outfile doMPI有模拟吗？一个相关的问题 - 在一个工

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与多对多处理器通信时发生MPI错误

我正在编写一个代码，其中每个处理器必须与多个处理器交互。例如：我有12个处理器，所以处理器0必须通信说1,2,10和9.让我们称它们为处理器0的邻居。同样我有处理器1必须通过说5，3 。处理器2必须与5,1,0,10,11 等通信。数据流是2种方式，即处理器0必须发送数据到1,2,10和9，并且也从它们接收数据。另外，标签计算中没有问题。我创建了是这样的代码： for(all neigh

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使用Open MPI和OpenMP进行并行处理

这可能是一个愚蠢的问题，无论如何，我正在处理一个令人尴尬的并行问题。我可以将工作分成可以并行执行的独立任务（无通信）。在外壳script.sh可以使用以下命令： #!/bin/bash let MY_ID=${OMPI_COMM_WORLD_RANK} ./a.out $MY_ID 在prog.c我们有一个简单独立的程序： #include <string.h> #include <s

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“libquadmath.la”不是一个有效的libtool档案”与gfortran

配置的openmpi当我试图配置我的openmpi与FORTRAN，gfortran，这就是我已经配置我的MPI。 ./configure --prefix=/usr/local/openmpi/2.0.1 --enable-mpi-fortran --enable-mpi-cxx --enable-mpi-thread-multiple 我在制作阶段出现此错误。 /usr/local/gn

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运行mpirun时无效的数据类型

我有一个简单的程序，我想在多台计算机上分散结构，但似乎我已经错误地定义了数据类型，即使程序编译正常。我有以下代码。 #include <mpi.h> #include <stdio.h> #include <stdlib.h> typedef struct small_pixel_s { double red; double green; double blu

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在Ubuntu 16.04上安装Rmpi VirtualBox

我在VM VirtualBox上创建了一个新的ubuntu-16.04.2-desktop-amd64机器，我希望能够在Rmpi中使用R环境。以下两种方法都会给出类似的错误。更新简化预建立的二进制方法：当Ubuntu的已安装的I开了一个终端并执行以下命令： ~$ sudo apt-get update ~$ sudo apt-get install openmpi-bin ~$ sudo

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如何获得MPI中的所有等级来发送一个值为0，然后在所有等级上进行阻止接收？

说我有n个过程：他们做一个计算，然后发送结果排名为0。这是我希望发生的：等级0将等待，直到它从结果所有的队伍，然后加起来。我该怎么做？另外，我想避免以下内容：例如， 4个进程P0，P1，P2，P3， P1 -> P0 P2 -> P0 P3 -> P0 与此同时P1已完成其计算等P1-> P0再次发生。我希望P0只在一个周期内完成3个过程的添加，然后再为下一个周期做3个过程。有

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在同一函数中调用MPI_Barrier两次可以吗？

在C中使用OpenMPI; 说我有 main() { MPI_Init(); //// Important Program Region MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); // do something here MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD); //// MPI_Finalize(); } 这是不好的做法？我能像这样

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doMPI错误：系统中没有足够的插槽可用于满足应用程序请求的2个插槽

我试图让我的本地机器上运行doMPI程序包，以便我可以在它之前对其执行测试将作业提交给群集。我正在使用Mac OSX Yosemite并通过brew安装了开放的mpi 2.0.2。 mpirun -V mpirun (Open MPI) 2.0.2 Report bugs to http://www.open-mpi.org/community/help/ 我已阅读过引进了doMPI我试图在演示

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ZeroMQ vs OpenMPI

有人可以提供什么更好，哪些情况？我有一些ZeroMQ的经验（不是很多），没有OpenMPI的经验。我知道这两个都是消息传递的框架。这两个框架的主要区别是什么？