pubchem

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    我目前正在做一个项目,我必须从代​​谢数据库PubChem中请求数据。我正在使用Apache的HttpClient。我做了以下情况: HttpClient httpclient = new DefaultHttpClient(); HttpGet pubChemRequest = new HttpGet("http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summa

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    我正在寻找从化学数据库中使用R,主要是name,CAS Number和molecular weight现在刮一些数据。但是,我无法获取rvest来提取我正在查找的信息。这是我到目前为止的代码: library(rvest) library(magrittr) # Read HTML code from website # I am using this format because I u

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    我想下载pubchem substance database并将所有信息放入MySQL数据库。这是可能的,如果是的话,如何? 是否有脚本会自动更新数据库?

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    我想从Pubchem数据库中提到的所有IUPAC名称中建立一些长度的前缀和后缀列表,以便我可以在我的项目中进一步使用它们作为特征。因此,我希望所有IUPAC化学名称都位于文本文件中或以某种格式提取这些列表。 Thanks.

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    以下R代码行会以斜体显示错误。这似乎是一个rpubchem错误,除非我做一些愚蠢的事: require(rpubchem); get.aid.by.cid(614467, type="raw") 输出: ***Warning messages: 1: In readLines(icon, n = 100) : seek on a gzfile connection ret

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    更新:答案中的链接既有趣又有用,但不幸的是没有解决对java API的需求,所以我仍然期待着任何输入。 我正在构建化合物数据库。我需要所有的同义词(IUPAC和通用名称)以及每个的安全数据。 我将使用在PubChem数据库免费提供的数据(http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/) 有简单的HTTP查询得到每种化合物的一种简单的方法。例如,为了获得甘油数据,网址是: http