sbatch

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我可以向SLURM提交“单行证”吗？使用由LSF和标准的Linux工具xargsbsub，我可以很容易地提交单独的作业进行解压缩所有文件的目录中： ls *.gz | sed 's/.gz$//g' | xargs -I {} bsub 'gunzip -c {}.gz > {}' 使用SLURM，我认为srun或sbatch会工作，但无济于事： ls *.gz | sed 's/.gz$/

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SLURM：如何在同一个计算节点或不同节点上并行运行不同的可执行文件？

目标：学习如何运行或共同计划或执行操作/使用或者SRUN或的mpirun 研究与sbatch作业提交应用：代码段： #!/bin/bash #SBATCH --job-name LEBT #SBATCH --partition=angel #SBATCH --nodelist=node38 #SBATCH --sockets-per-node=1 #SBATCH --cores-p

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以指定数量的节点启动slurm阵列作业

我正在尝试使用slurm 14.03.0版在我们的HPC上对齐168个序列文件。我只允许一次最多使用9个计算节点，以便为其他人保留一些节点。我改变了文件名，所以我可以在sbatch中使用数组函数。序列文件看起来像这样： Sequence1.fastq.gz，Sequence2.fastq.gz，... Sequence168.fastq.gz 我似乎无法弄清楚如何告诉它运行所有168个文件，9一

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在Slurm群集上运行批处理作业

因此，我花了几个小时试图弄清楚这一点，并希望得到任何帮助。我所试图做的是用SLURM --array0-654 我想每个作业步骤运行8个线程运行批处理作业。我有权访问集群上的每个32个线程的11个节点，我似乎无法得到正确的SBATCH配置。它似乎要么为每个节点运行一个作业，要么在所有节点上运行超过200个作业。我试过了许多不同的配置，并想知道是否有人有一些建议。