R中的重塑矩阵

Question

我正在努力寻找一种自动方式来重塑我的矩阵。请参阅我的示例输出，了解如何重新构建它。

 Change Position1 Position2 Position3  Position4 
Gene1 2.3  1   1    1    0 
Gene2 -1.3  0   1    1    1 
Gene3 0.4  0   0    1    1 

输出：

Position  1 or 0  Change 

Position1  1   2.3 
Position1  0   -1.3 
Position1  0   0.4 
Position2  1   2.3 
Position2  1   -1.3 
Position2  0   0.4 
... 

Answer 1

如果你在你的数据，如

dd<-read.table(text="  Change Position1 Position2 Position3  Position4 
Gene1 2.3  1   1    1    0 
Gene2 -1.3  0   1    1    1 
Gene3 0.4  0   0    1    1", header=T) 

阅读，你可以只使用

library(reshape2) 
melt(dd, id.vars="Change") 

# Change variable value 
# 1  2.3 Position1  1 
# 2 -1.3 Position1  0 
# 3  0.4 Position1  0 
# 4  2.3 Position2  1 
# 5 -1.3 Position2  1 
# 6  0.4 Position2  0 
# 7  2.3 Position3  1 
# 8 -1.3 Position3  1 
# 9  0.4 Position3  1 
# 10 2.3 Position4  0 
# 11 -1.3 Position4  1 
# 12 0.4 Position4  1