如何将Pajek .paj文件导入到R的igraph中？

Question

This tutorial和package documentation描述了如何为.net格式的pajek文件执行此操作，但我需要导入.paj文件。我不希望有代码能够导入所有的.paj文件，但也许有人的代码可以用于一些更简单的代码，然后我可以修改它们用于我的目的？

Answer 1

我会用下面的方法启动：

1. 阅读使用readLines()整个文件。
2. 删除注释行，以'%'开头的行。
3. 将线条切成小块，以星号（'*'）开始的线条标记新片段的开始。
4. 检查每件作品出现的顺序并将其转换为适当的R数据结构。

在第4步，你可能有件几种类型：

• *Network是网络的开始。
• *Vertices定义了顶点并属于之前的网络。
• *Edges定义了无向边，它属于前一个网络。
• *Arcs定义有向边，它属于以前的网络。
• *Partition是分区的开始。
• *Vector是一个向量的开始。

对于*Network片转换成的igraph曲线图中，与*Vertices，*Edges和/或*Arcs，经过右它来片粘合在一起，然后通过一个textConnection()调用read.graph(..., format="pajek")。这样你就不需要创建临时文件。

该*Partition和*Vector件很简单，只是将它们转换为R向量，使用scan()和textConnection()。

我还没有尝试过所有这些，但我认为这不是太困难，应该可以正常工作。告诉我，如果你有任何困难。

此外，Pajek文件格式记录不完整，所以我可能是错的，可能还有其他类型的片等

您也可以考虑在igraph bug tracker加入一个bug报告，请求该功能。