如何在R中导入.tsv文件？

我需要阅读的表如何在R中导入.tsv文件？

test <- read.table(file='drug_info.tsv') 
# Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, : 
# line 1 did not have 10 elements 
test <- read.table(file='drug_info.tsv',) 
# Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, : 
# line 1 did not have 10 elements 
scan("drug_info.tsv") 
# Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, : 
# scan() expected 'a real', got 'ChallengeName' 
scan(file = "drug_info.tsv") 
# Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, : 
# scan() expected 'a real', got 'ChallengeName'

我应该如何看呢？

来源

2015-10-24 Andrew Voronkov

请复制/粘贴文件的前5行到您的问题，并删除图片。 –

使用缺省设置 – rawr

'read.table'默认使用空格分隔符（通常表示空格或制表符）。如果你有空格，你可以使用'sep =“\ t”'明确地将分隔符设置为tab。 'read.table'与有效的输入文件一起工作，所以如果在导入数据时出现问题，它与文件相关，而不是函数。因此，为了帮助您，我们需要您分享您实际尝试导入的文件样本，而不是其他程序中的数据图片。 – MrFlick

这应做到：

read.table(file = 'drug_info.tsv', sep = '\t', header = TRUE)

来源

2015-10-24 19:26:14 Robert

这应该会给出与报告相同的错误，第1行没有足够的元素 – RobertH

我认为这里的回调过早有点过早，因为我们没有任何实际的数据可以用任何方法测试。 –

假设只有第一行没有元素的权数，并认为这是列名行。跳过第一行：

d <- read.table('drug_info.tsv', skip=1)

现在读它

first <- readLines('drug_info.tsv', n=1)

检查它，解决它，使得它的元素的数量相匹配d然后

colnames(d) <- first

如果不工作，你可以做

x <- readLines('drug_info.tsv')

和这样的诊断：

sapply(x, length)

来源

2015-10-24 19:52:04 RobertH

如何在R中导入.tsv文件？

回答

相关问题