提取热图的特定成员中的R

Question

我产生的热图基于一个4500行×400山口矩阵m：

hm<-heatmap(m, na.rm=TRUE, col=bluered(256)) 

那么，如何看到特定集群的成员？我读了一下，知道我必须使用'cutree（）'，但我仍然不确定如何正确实现它。

谢谢。

Answer 1

hm<-heatmap.2(m, na.rm=TRUE) 
clstrs <- cutree(as.hclust(hm$rowDendrogram), 1:dim(m)[1]) 

并根据您需要多少个群集，选择正确的列。因此，如果你想要7个簇：

clstrs[, 7] 

会告诉你每个元素属于哪个簇。