在ggplot中针对不同分类水平绘制不同的颜色

我有这个数据框由样本ID，PCA值和各自的总体组成。 my dataframe 在ggplot中针对不同分类水平绘制不同的颜色

我已经产生，使用以下命令，使用python中ggplot这个数据MDS情节：

from ggplot import * 
print ggplot(aes(x='C1', y='C2'), data=mds)+ geom_point(alpha=0.6, colour='black', fill='red') + ggtitle('My plot')

和剧情是这样的： My MDS plot

我想知道我怎么能根据他们的人口标签为每个人分配不同的颜色？

来源

2016-05-31 Reza Jabal

我没有使用python一大堆，当我这样做不是为了绘制图形，而是使用R的ggplot2软件包的经验会让我相信，你将人口变量抛到geom_point调用下，如下所示： ''... geom_point（aes（fill = Population），alpha = 0.6，color ='black'）...''在黑暗中拍摄一张照片。同样在R的ggplot2 geom_point调用默认形状（如图中使用的那样）不能接受填充命令，所以我认为它应该是color = Population。 –

Mer30 Cyrus，我会试试！ –

这应该这样做：

from ggplot import * 

p = ggplot(aes(x='C1', y='C2', color='Population'), data=mds)+ geom_point(alpha=0.6) + ggtitle('My plot') 

print p

确保周围有列名的报价，并有你aes函数内color说法。

来源

2016-05-31 12:17:44 Abdou

在ggplot中针对不同分类水平绘制不同的颜色

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