Qsub导致脚本无法正常工作：“未找到命令”

Question

我正在运行接受5个命令行参数的脚本“example.sh”。

这工作得很好：

./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 

，它返回一个文件result1.txt现在

当我尝试运行它在SGE集群（带或不带 “./”）：

qsub ./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 

这不会导致任何输出。

在example.sh.eXXXXXXX文件，我得到：

arg1=1: Command not found. 
arg2=2: Command not found. 
... 
and so on. 

我不知道为什么它不与qsub命令工作。我还在我的脚本顶部插入了一个

#!/usr/bin/env bash 

。我一直在调整一些东西，试图在stackoverflow和web上找到不同的东西，但到目前为止还没有成功（我试过了-S和-F标志）。任何建议表示赞赏指向我在正确的方向。

Answer 1

qsub不会接受你的shell脚本的论点这样，但任何一项都将工作：

1）把./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5到另一个脚本，例如command.sh，然后运行qsub command.sh。

2）将全部命令管理为qsub作为标准输入，例如：echo ./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 | qsub。