要通过hclust R中

重新排序数据，我看到这些代码从这里：http://learnr.wordpress.com/2009/08/10/ggplot2-version-of-figures-in-lattice-multivariate-data-visualization-with-r-part-9/要通过hclust R中

hc1 <- hclust(dist(USArrests, method = "canberra")) 
hc1 <- as.dendrogram(hc1) 
ord.hc1 <- order.dendrogram(hc1) 
hc2 <- reorder(hc1, state.region[ord.hc1]) 
ord.hc2 <- order.dendrogram(hc2) 
region.colors <- trellis.par.get("superpose.polygon")$col 
USArrests2 <- melt(t(scale(USArrests))) 
USArrests2$X2 <- factor(USArrests2$X2, levels = state.name[ord.hc2])

但我在第四行有关state.region变量很困惑。

订单的变量是ord.hc1是从USArrests生成的，这似乎与state.region无关。那么为什么它使用state.region重新排序而不是USArrests数据框中的一列？

来源

2012-06-07 Hanfei Sun

你能告诉我哪个软件包有这些数据吗？ – Subs

@Subs，它是'datasets'的一部分：http://stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/datasets/html/USArrests.html – Ben

和'state.region' is'a factor giving每个国家所属的地区（东北，南，北中，西）。“比照http://stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/datasets/html/state.html – Ben

看看在state.region帮助文件 -

?state.region

第一句下详细，是

R currently contains the following "state" data sets. 
Note that all data are arranged according to alphabetical 
order of the state names.

这意味着我们可以在美国数据集之间的跳跃，因为它们是全部在相同的顺序，即USArrests的第一个条目的状态是与state.region中的状态相同。

来源

2012-06-08 07:25:30 csgillespie

要通过hclust R中

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