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我需要将DNA序列翻译成其相应的氨基酸序列。我编写了整个程序,但是我在输出生成方式方面遇到困难。Python嵌入变量输出
总之,我有这样的代码:
for x in f1:
x = x.strip()
if x.count("seq"):
f2.write((x)+("_1_+\n"))
f2.write((x)+("_2_+\n"))
f2.write((x)+("_3_+\n"))
f2.write((x)+("_1_-\n"))
f2.write((x)+("_2_-\n"))
f2.write((x)+("_3_-\n"))
else:
f2.write((translate1(x))+("\n"))
f2.write((translate2(x))+("\n"))
f2.write((translate3(x))+("\n"))
f2.write((translate1neg(x))+("\n"))
f2.write((translate2neg(x))+("\n"))
f2.write((translate3neg(x))+("\n"))
,让这样的输出:
>seq1_1_+
>seq1_2_+
>seq1_3_+
>seq1_1_-
>seq1_2_-
>seq1_3_-
iyyslrs-las-smrlssiv-m
fiirydrs-ladrcgshrssk
llfativas-lidaalidrl
frrsmraasis-lativannkm
lddr-ephrsas-lrs-riin
-tidesridqlasydrse--m
但我需要的是这样的:
>seq1_1_+
iyyslrs-las-smrlssiv-m
>seq1_2_+
fiirydrs-ladrcgshrssk
>seq1_3_+
llfativas-lidaalidrl
>seq1_1_-
frrsmraasis-lativannkm
>seq1_2_-
lddr-ephrsas-lrs-riin
>seq1_3_-
-tidesridqlasydrse--m
所以,我的问题是,我该如何解决这个问题?
您正在将它们一起印刷。这很明显,为什么输出是如此... – gravetii
看起来像你把不适合的东西混合成一个数据结构。请发布您的整个程序,以便我们能够更好地帮助您。 – Michael