2013-03-07 29 views
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我想重建是这样的:如何使用python // Matplotlib重新创建此图形?

但用我自己的数据。我的数据如下所示:

Number Name1  Structure  mean stdev 
1   Aldehydes RCH=O  122.76 7.67 
2   Ketones   R2C=O  8.11  0.15 
2   Amides  R-CONr2  20.1  83.24 

我该如何重新创建这个图?我得到尽可能:

from pylab import * 
import numpy 
data = numpy.genfromtxt('data',unpack=True,names=True,dtype=None) 
pos = arange(size(data['Number'])) 
ax2.errorbar(pos,data['mean'], yerr=data['stdev']) 

但我不能让这个情节类似于我的例子。有人可以为此发布示例代码吗?

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使用'errorbar(...,XERR =数据[ 'STDEV'])'得到的水平误差条 – tacaswell 2013-03-07 14:10:18

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SO是询问你的代码_specific_问题的地方。告诉我们你做了什么,你认为它应该做什么,以及它在做什么,你会得到帮助。请求我们为您编写代码,并且您将被忽略。 – tacaswell 2013-03-07 14:30:01

回答

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您可以先将您的数据绘制为错误栏,然后使用相应的文本对其进行注释。

下面是一个简单的代码为你下手:

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 

data = np.genfromtxt('data.txt', unpack=True,names=True,dtype=None) 

fig, ax = plt.subplots() 
ax.set_yticklabels([]) 
ax.set_xlabel(r'ppm ($\delta$)') 
pos = np.arange(len(data)) 
#invert y axis so 1 is at the top 
ax.set_ylim(pos[-1]+1, pos[0]-1) 
ax.errorbar(data['mean'], pos, xerr=data['stdev'], fmt=None) 

for i,(name,struct) in enumerate(zip(data['Name1'], data['Structure'])): 
    ax.text(data['mean'][i], i-0.06, "%s, %s" %(name, struct), color='k', ha='center') 

plt.show() 

image

改变你的注释单个字母的颜色会很棘手,因为matplotlib不支持五彩文本。我试图通过使用正则表达式来注释两次相同的文本(一个只用红色“C”而另一个没有“C”)来找到解决方法,但是因为每个字母不占用相同的空间,所以它不会对于所有的单词都很好(见下文)。

#add to the import 
import re 

#and change 
for i,(name,struct) in enumerate(zip(data['Name1'], data['Structure'])): 
    text_b = ax.text(data['mean'][i], i-0.05, "%s, %s" %(name, struct), color='k', ha='center') 
    text_b.set_text(text_b.get_text().replace('C', ' ')) 
    text_r = ax.text(data['mean'][i], i-0.05, "%s %s" %(name, struct), color='r', ha='center') 
    text_r.set_text(re.sub('[abd-zABD-Z]', ' ', text_r.get_text())) 
    text_r.set_text(re.sub('[0-9\=\-\W]', ' ', text_r.get_text())) 

img2

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