在GGRAPH包“对象‘方向’找不到”与树状

我尝试绘图与ggraph包树状图，但它的确定与geom_edge_diagonal()但与geom_edge_elbow()在GGRAPH包“对象‘方向’找不到”与树状

包

library(phyloseq) 
library(igraph) 
library(ggraph)

获取数据

文件ps.rds在这里可用

ps <- readRDS("ps.rds") 

EdgeList <- phy_tree(ps)$edge 
Tree <- graph_from_edgelist(EdgeList, directed = TRUE)

绘制

ggraph(Tree, 'dendrogram') + 
    geom_edge_diagonal()

此代码的作品，但情节不是很美观。

现在：

ggraph(Tree, 'dendrogram', circular = TRUE) + 
    geom_edge_elbow() 

Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'direction' not found

所以我有一些问题：

为什么它不工作yhereas它适用于其他的树状图？
什么是方向？在包文档中，据说方向是“自动设置的”https://www.rdocumentation.org/packages/ggraph/versions/0.1.1/topics/geom_edge_elbow
我可以在ps对象中找到一些有用的绘图吗？

F.Privé的评论后编辑

是的，它可以混合dendrogram和circular。

ggraph(Tree, 'dendrogram', circular = TRUE) + 
    geom_edge_diagonal()

2017-07-25 AntoineBic

当我在你的例子打球，我得到的错误“循环布局只适用于树和DAG布局”。你确定你可以在'circular = TRUE'中使用'layout ='dendrogram''吗？ –

对于一些原因，可能过于棘手，在这里讨论，geom_edge_elbow目前只支持dedrogram/hclust对象，而不是IGRAPH对象。

我可能已经找到一种方法周围的下一个版本

2017-07-25 13:54:29 ThomasP85

好的，谢谢。我会等待下一个版本;） – AntoineBic

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