bioconductor

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    在GGRAPH包“对象‘方向’找不到”与树状

    我尝试绘图与ggraph包树状图，但它的确定与geom_edge_diagonal()但与geom_edge_elbow() 包 library(phyloseq) library(igraph) library(ggraph) 获取数据 文件ps.rds在这里可用 https://github.com/spholmes/F1000_workflow/tree/master/data ps
    r ggplot2 igraph bioconductor ggraph 2017-07-25

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    从随机标记数据帧的行中创建因子向量

    我有一个110行的数据框，它是来自微阵列实验表达式集对象的pData。我想创建一个2级因子向量，随机分配给行（代表实验样本）。例如，如果在实验中有110行对应于110个主题，我希望将55行设置为“G0”，将55设置为“G1”。这些组用于后续功能。 我目前想这是一个函数内包裹下面我想修改： # makes a numeric vector of the number of subjects/rows
    r random bioconductor 2017-07-26

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    ggtree中的getSubtree函数，没有这样的函数

    我已经安装了ggtree包v1.8.2，并且我想使用getSubtree函数。不过，我得到一个错误suprising :)： 错误getSubtree（）：找不到功能“getSubtree” 即使我看到Rstudio帮助机能的研究作为ggtree包的成员和正如它在软件包描述中提到的：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/ggt
    bioconductor ggtree 2017-09-28

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    TCGABiolinks错误：名称（y）< - 1：长度（y）：'名称'属性[2]中的错误长度必须与向量[0]的长度相同

    任何有关为什么我会收到错误在TCGABiolinks中运行标准化步骤？
    r normalization bioinformatics bioconductor 2017-08-12

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    如何在我的R功能中使用特定于平台的软件包

    我的R软件包具有使用另一个软件包（foo）中的函数（bar）的函数（my_func），该函数只能在Unix上使用。所以，我写我的代码这样，继suggested packages in Writing R extension： my_func = function(){ .... if (requireNamespace("foo", quietly = TRUE)) { fo
    r dependencies bioconductor 2017-08-16

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    特拉维斯未能对R BIOC包中使用新的乳胶格式

    我有一个Bioconductor的包，我们正在向最后一个版本编译的护身符，我特拉维斯过程中不被丢失的风格字体的错误：beramono.sty： https://travis-ci.org/lpantano/isomiRs 创建晕影的包装是BiocStyle和它们引入这种依赖性： https://github.com/Bioconductor/BiocStyle/search?utf8=✓& q =
    r latex bioconductor 2017-08-17

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    达到最大数量的DLL

    当我尝试加载新库时，在R中出现此错误。 Installation failed: unable to load shared object 'C:/R/R-3.4.0/library/curl/libs/x64/curl.dll': `maximal number of DLLs reached... 这与curl无关，它可能是任何库。我sessionInfo看起来象下面这样： R
    r bioconductor 2017-08-24

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    计算给定的一段核苷酸拉伸的核苷酸频率

    我有一个xyz.txt文件，其格式如下。 AATGCC AAGAAA AAGGAA AAGGTA AAGCAG AAGCGA 所有我想做的事就是上传中，我做了这个命令R环境： library(Biostrings) string <- read.table("/home/Folder/MY_FOLD/MYZ/mp.txt") 现在因为我想通过这个命令来获得四种核苷酸序列的频率： st
    r string bioinformatics bioconductor 2017-07-14

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    mas5正常化错误：无法找到函数的继承方法

    目标：mas5正常化数据。 问题：当我尝试以下方法R代码里面，我得到这个 error: unable to find an inherited method for function bg.correct for signature ExpressionFeatureSet, character 我有这么看着，发现以下几点：What does this mean: unable to find
    r bioinformatics bioconductor 2017-09-04

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    作为grob捕获complexheatmap的输出？

    ComplexHeatmap作为一种情节类型，它是一种神像发送工具，与热图相关。作为multipanelfigure的作者之一，我不能找到一个直接的解决方案来捕获grid::grob对象中生成的热图输出，以便于将其包含在由multipanelfigure生成的科学化合物图中。 任何指针？ 荷兰Joh
    r graphics bioconductor 2017-07-18
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