消除NA的和绑定两个列值并绘制结果中的R

我这个代码消除NA的和绑定两个列值并绘制结果中的R

dd <- melt(b,id.vars=c("Mesocosm","Exp.day"), measure.vars=myvars) 
dd$Exp.day = factor(dd$Exp.day,levels = order(levels(dd$Exp.day))) 
ggplot(dd,na.rm=TRUE,aes(x=Exp.day,y=value)) + geom_point(aes(color=factor(Mesocosm)), size = 3,position = position_jitter(width = 0.1)) + 
    facet_wrap(~variable, nrow=3, ncol=2,scales = "free_y")

绘图数据和数据失真的许多方面。导入到R后的数据帧不会为大多数空格放置任何NA，并且在融化后Exp.day轴中有NA。

我没有任何想法如何处理ggplot内的NA，以及为什么Y轴被扭曲。请让我知道如何解决这些问题。

在这里您可以看到NA值不存在，我的意思是您可以在0处看到没有连续值。（颜色不是问题，但绘制的数据与数据框值不匹配），看起来像Y轴有多个值。如何解决这个问题？

在此先感谢

来源

2014-06-15 statisticalbeginner

目前还不清楚你认为我的问题是什么，当我制作图表时y轴看起来不像你的。确保你已经正确地阅读了数据，并且每一列都是你期望的课程。更具体地说明“扭曲”对你意味着什么。你期望发生的NA值现在还没有发生什么？我们不知道这些情节“应该”看起来像什么。 – MrFlick

我已添加预期结果。并且我正在使用此命令将数据帧导入到R ..“b < - read.xls（”file_name.xls“，perl =”C：/strawberry/perl/bin/perl.exe“）” – statisticalbeginner

您不'您需要尝试编辑答案以提供反馈，您可以在其下方发表评论。 – Leigh

好，ggplot似乎并不具有na.rm参数。从数据中删除缺失值的最佳方法是将它们分组。尝试

ggplot(subset(dd, !is.na(Exp.day)),aes(x=Exp.day,y=value), as.table=T) + 
    geom_point(aes(color=factor(Mesocosm)), size = 3, 
     position = position_jitter(width = 0.1)) + 
    facet_wrap(~variable, nrow=3, ncol=2,scales = "free_y")

这给了我

enter image description here

如此看来，当你在读你的表格，你的列没有被正确设置为数值。它们可能是您data.frame中的因素，但是您没有提供确切的data.frame结构来验证。只要确保数据集中的所有数字列都是R中的数字，并且如果不是，则进行必要的转换。

来源

2014-06-15 03:16:31 MrFlick

你是如何设法将所有列转换为数字的？我努力工作，但是NA正在努力完成我的任务。如果你不介意，请分享你的方法。谢谢。 – statisticalbeginner

好吧，不得不将它下载为excel文件。我用单位删除了第二行。我保存为一个制表符分隔的文本文件，并用'read.table（）'将其读入。 – MrFlick

消除NA的和绑定两个列值并绘制结果中的R

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