在open-mpi/mpi-run中加载共享库

我试图使用mpi运行使用转矩调度程序来运行我的程序。虽然在我的PBS文件我加载的所有图书馆通过在open-mpi/mpi-run中加载共享库

export LD_LIBRARY_PATH=/path/to/library

但它给错误即

error while loading shared libraries: libarmadillo.so.3: 
cannot open shared object file: No such file or directory.

我猜的错误在于在所有节点没有设置变量LD_LIBRARY_PATH。我将如何使它工作？

来源

2012-07-06 zimbra314

你可以在这里发布你的PBS脚本吗？ – chrisaycock 2012-07-06 19:09:42

LD_LIBRARY_PATH不会自动导出到MPI进程，产生mpirun。您应该使用

mpirun -x LD_LIBRARY_PATH ...

推送的值为LD_LIBRARY_PATH。还要确保指定的路径存在于群集中的所有节点上，并且在任何地方都可以使用libarmadillo.so.3。

来源

2012-07-06 19:36:34

如果使用本地Torque/TM支持编译Open MPI，则应自动将LD_LIBRARY_PATH（和环境的其余部分）传播到分配中的所有节点。如果Open MPI不是使用原生Torque支持构建的，那么我猜你正在使用rsh/ssh来启动，在这种情况下，“-x LD_LIBRARY_PATH”子句是必需的。我实际上建议用Torque/TM支持重新构建OMPI;由于多种原因，它比rsh/ssh支持要好。 – 2012-07-09 14:56:14

谢谢。我用这个SHIT驱动MAD ....导出LD_LIBRARY_PATH应该让子进程使用这些变量，但事实证明它并不是。 – 2016-03-22 22:56:10

@GregK。导出只适用于在mpiexec运行的同一节点上启动的进程，因为这些进程是后者的子进程。在远程节点上启动的进程是相应ORTE牧羊人守护进程的子进程，并且不直接继承“mpiexec”环境，而仅仅是转发到守护进程并由其另外设置的环境。（我可能是错的;杰夫斯派雷斯更清楚） – 2016-03-22 23:29:20

在某些系统上，您的环境并不总是通过mpirun传播。您应该在.bashrc文件中设置所有这些变量。

来源

2012-07-06 19:12:59 eduffy

在open-mpi/mpi-run中加载共享库

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