R igraph - 将加权邻接矩阵转换为加权边界列表

我有一个nxm邻接矩阵，其中（i，j）表示i和j之间的关联分数。我需要将其转换为如下格式： i j <score1>R igraph - 将加权邻接矩阵转换为加权边界列表

使用R'igraph软件包并将其输出到文本文件中。

我可以派生边界列表，但它没有权重显示出来。我用下面的代码：

library(igraph) g <- graph.adjacency(myAdjacencymatrix) get.edgelist(g)

但是，它不显示的权重。

2014-07-14 Benny

A [reproducible example]（http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example）在这里会有所帮助。 – MrFlick

library(igraph) 
set.seed(1)    # for reproducible example 
myAdjacencyMatrix <- matrix(runif(400),nc=20,nr=20) 

g <- graph.adjacency(myAdjacencyMatrix,weighted=TRUE) 
df <- get.data.frame(g) 
head(df) 
# from to weight 
# 1 1 1 0.2655087 
# 2 1 2 0.9347052 
# 3 1 3 0.8209463 
# 4 1 4 0.9128759 
# 5 1 5 0.4346595 
# 6 1 6 0.6547239

您需要调用使用weighted=TRUE到graph.adjacency(...)有分配到边缘的权重。然后，get.data.frame(...)将默认返回包含所有边属性的边的数据帧。您可以使用what=...参数返回例如带属性的顶点列表。

未来：提供了一个例子，而不是强迫我们为你创造一个！

来源

2014-07-14 20:29:52 jlhoward

R igraph - 将加权邻接矩阵转换为加权边界列表

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