的R - gplots - 在heatmap.2卸下空格键时= FALSE

Question

我有：

library(gplots); 
x<-matrix(seq(1:100),nrow=10,byrow=TRUE); 
heatmap.2(x, Rowv=NA, Colv=NA, scale="none", main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", col=gray((255:0)/255), dendrogram="none",trace="none", key=FALSE); 

当键被指定为FALSE，有白色空间上图的左侧的块这会阻止完整的标题出现，与手动指定较小的页边空白相冲突，并将热图向右移动。白色空间的宽度是可控的使用"keysize=#"，但是使它太小（0.8和1.0之间的某处）创建了一个错误："Error in plot.new() : figure margins too large"

我会尝试用heatmap()代替heatmap.2()这样做，但热图无法播放以及我需要一个项目的par()。如果有人有任何建议，我会很感激。

Answer 1

heatmap.2图的定位元素可以使用布局参数完成。

layout(mat = lmat, widths = lwid, heights = lhei) 

我得到一个相当可接受的热图使用以下内容。

heatmap.2(x, 
    Rowv=NA, 
    Colv=NA, 
    scale="none", 
    main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", 
    col=gray((255:0)/255), 
    dendrogram="none", 
    trace="none", 
    key=FALSE, 
    lmat=rbind(c(2),c(3),c(1),c(4)), 
    lhei=c(1,1,9,0), 
    lwid=c(1) 
    ); 

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