Renside和Rcpp在C++ x11

我想在C++ x11代码中使用RInside来调用R例程。默认情况下，R似乎安装了库的C++ 98版本，因此链接不成功。我想知道我应该如何安装C++ x11版本的RInside（但是我想我需要重新编译所有R/R软件包，是否？）以及是否存在一些更简单的解决方案。在此先感谢（我在MacOS工作）Renside和Rcpp在C++ x11

更新：我重新安装RCPP和RInside做（我Makevars是空的，所以C++ 98版）

sudo R CMD INSTALL ~/Downloads/Rcpp_0.10.4.tar.gz 
sudo R CMD INSTALL ~/Downloads/RInside_0.2.10.tar.gz

然后我使用编译Hello World示例（没有CX11）：

clang++ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Headers/ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/RInside/include/ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/Rcpp/include/ -c ../src/Gui/test.cc -o testOut.cc.o 

clang++ testOut.cc.o -o testOut -L/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/RInside/lib/x86_64 -L/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/Rcpp/lib/x86_64 -framework R -lRInside -lRcpp

产生了我：

Hello, world!

Howev呃，加入X11选项：

clang++ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Headers/ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/RInside/include/ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/Rcpp/include/ -c ../src/Gui/test.cc -o testOut.cc.o -stdlib=libc++ -std=c++11 

clang++ testOut.cc.o -o testOut -L/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/RInside/lib/x86_64 -L/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/Rcpp/lib/x86_64 -framework R -lRInside -lRcpp -stdlib=libc++ -std=c++11

我得到（链接时）：

Undefined symbols for architecture x86_64: 
    "RInside::parseEvalQ(std::__1::basic_string<char, std::__1::char_traits<char>, std::__1::allocator<char> > const&)", referenced from: 
    _main in testOut.cc.o 
    "RInside::operator[](std::__1::basic_string<char, std::__1::char_traits<char>, std::__1::allocator<char> > const&)", referenced from: 
    _main in testOut.cc.o 
    "Rcpp::Environment::assign(std::__1::basic_string<char, std::__1::char_traits<char>, std::__1::allocator<char> > const&, SEXPREC*) const", referenced from: 
     bool Rcpp::Environment::assign<char [15]>(std::__1::basic_string<char, std::__1::char_traits<char>, std::__1::allocator<char> > const&, char const (&) [15]) const in testOut.cc.o

当使用C++ X11选项重新编译RCPP和RInside

clang++ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Headers/ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/RInside/include/ -I/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/Rcpp/include/ -c ../src/Gui/test.cc -o testOut.cc.o -stdlib=libc++ -std=c++11 

clang++ testOut.cc.o -o testOut -L/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/RInside/lib/x86_64 -L/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library/Rcpp/lib/x86_64 -framework R -lRInside -lRcpp -stdlib=libc++ -std=c++11

的喜好就可以了但./test给我一个seg故障。

加：我铿锵的版本是：苹果铛版本4.1（标签/苹果/铛-421.11.66）

来源

2013-10-16 user1835313

我想说，如果你的程序在最简单的例子中饱受折磨，那么你并没有“成功”建立图书馆。也没有必要重新印刷多年来一直在RInside回购和分销的源代码。 –

R是一个C编译器来编译。你不一定需要使用它来构建包。因此，使用clang编译添加包是完全有效的。我有这个在我的~/.R/Makevars文件中使用铛和C++包11：

CC=clang 
CXX=clang++ 
CXXFLAGS= -stdlib=libc++ -std=c++11

此外，你可能想看看Rcpp11，RCPP的C++ 11为中心的重新设计。这可能不会太难，可以让RInside使用Rcpp11代替Rcpp。

来源

2013-10-16 13:01:44

我不知道不同的链接器要求。你有什么应该工作。否则，请显示您的实际链接步骤和错误，最好以我可以在我的最后看到的可重现的方式。

见证以下内容。我们首先建立与默认的标志：

[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$ grep ^CXXFLAGS ~/.R/Makevars 
CXXFLAGS=    -g -O3 -Wall -pipe -Wno-unused -pedantic # plain C++ 
[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$ make rinside_sample0 
ccache g++-4.7 -I/usr/share/R/include \ 
    -I/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include \ 
    -I/usr/local/lib/R/site-library/RInside/include -g -O3 -Wall \ 
    -pipe -Wno-unused -pedantic -Wall \ 
    rinside_sample0.cpp -L/usr/lib/R/lib -lR -lblas \ 
    -llapack -L/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib -lRcpp \ 
    -Wl,-rpath,/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib \ 
    -L/usr/local/lib/R/site-library/RInside/lib \ 
    -lRInside -Wl,-rpath,/usr/local/lib/R/site-library/RInside/lib \ 
    -o rinside_sample0 
[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$ ./rinside_sample0 
Hello, world!  
[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$

现在我简单地增加-std=c++11我CXXFLAGS：

[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$ grep ^CXXFLAGS ~/.R/Makevars 
CXXFLAGS=    -g -O3 -Wall -pipe -Wno-unused -pedantic -std=c++11 
[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$

和改造二进制：

[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$ rm rinside_sample0 
[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$ make rinside_sample0 
ccache g++-4.7 -I/usr/share/R/include \ 
-I/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include \ 
-I/usr/local/lib/R/site-library/RInside/include \ 
-g -O3 -Wall -pipe -Wno-unused \ 
-pedantic -std=c++11 -Wall \ 
    rinside_sample0.cpp -L/usr/lib/R/lib -lR \ 
-lblas -llapack -L/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib -lRcpp \ 
-Wl,-rpath,/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/lib \ 
-L/usr/local/lib/R/site-library/RInside/lib \ 
-lRInside -Wl,-rpath,/usr/local/lib/R/site-library/RInside/lib \ 
-o rinside_sample0 
[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$ ./rinside_sample0  
Hello, world!   
[email protected]:~/svn/rinside/pkg/inst/examples/standard$

部署C++ 11，你不需要一个新的编译器或项目。

只需将一个选项添加到您的编译器标志 - 这很容易。

而只是为了使它更简单的，我们也可以这三个行添加到rinside_sample0.cpp，使之成为C++ 11方案：

auto magic = 42;     // C++11 
R["magic"] = magic;      
R.parseEvalQ("print(magic)");

和（与所需-std=c++11标志），它也建立和运行。 在Rcpp或RInside端，请谨慎地不需要更改以使用支持C++ 11的编译器部署它们。

来源

2013-10-16 13:42:03

对不起，我有点失落。你是否建议我不需要重新编译RInside和Rcpp？ – user1835313

这就是我刚刚演示的例子。 –

谢谢你的帮助。请参阅我的编辑。 – user1835313

Renside和Rcpp在C++ x11

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