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我想绘制一些情节和每个分段取决于分数我想绘制颜色作为从蓝色( - 值) - 白色(0值) - 红色(+值)。 现在使用我的代码的Segments部分我可以做到这一点,如果我给出一个特定的颜色,如col="red" or col="blue"
,它很好。所以,由于我的数据的庞大规模,我想用那么自动化它:R调色板不打印指定的颜色
rbPal <- colorRampPalette(c('red','white','blue'))
jcolor<-rbPal(nrow(datasetsize))
的问题是,当我到达绘图数据,它只是绘制颜色随机,而不是我一直在使用的颜色分配的颜色即使检查html颜色代码,调色板也是正确的颜色。任何帮助将不胜感激。 (请参见下面的代码)
测试数据:
Sample loc Start End p sm
S1 9 1000000 10000000 2 -7.5751
S2 9 11000000 18000000 6 -1.5906
S3 9 20000000 40000000 3 0
S4 9 50000000 70000000 2 0.8
S5 9 80000000 100000000 2 1.25
S6 9 110000000 140000000 6 7.789
代码:
### Read in Data
data<-read.table("stack_eg.txt",header=TRUE,sep="\t")
### Order Setdata Object
data<-data[order(data$sm,decreasing=T),]
### Setup Plot Space
plot(1, type="n", axes=T, xlab="X", ylab="Y",ylim=c(1,6),xlim=c(0,142000000))
### Color setup
rbPal <- colorRampPalette(c('red','white','blue'))
jcolor<-rbPal(6)
jonzo<-cbind(data,jcolor)
### Plot data
for(l in 1:nrow(jonzo)){
startpos<-jonzo$Start[l]
endpos<-jonzo$End[l]
segments(startpos,2,endpos,2,col=jonzo$jcolor[l])
}
感谢小费。我注意到,从jonzo读取颜色代码似乎是一个问题。如果我删除它,只需从jcolor中拉出颜色,效果很好。 – Jcrow06