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我正在使用NetworkX生成一些噪音数据的图形。我想通过删除虚假的分支来“清理”图表,并希望避免重新发明轮子。修剪NetworkX图形的功能?
例如,链接的图片显示了一组样图,作为通过灰线连接的彩色节点。我想修剪由白色框指示的节点/边缘:http://www.broadinstitute.org/~mbray/example_tree.png
实质上,要移除的节点/边缘通常只有少数节点(长度为< 3)。通过删除它们,我希望有一棵树具有最小的分支,但保留的分支是“适当”的长。
在我开始创建代码以检查要删除的子树之前,有没有可用于此目的的NetworkX函数?
我喜欢这个,至少作为开始。分支通常是非常不对称的,所以找到一个修剪阈值不应该太难。谢谢! – braymp