awk if-then-else语句错误

我正在使用awk在bash脚本中编写if-then-else语句。awk if-then-else语句错误

我想要做的是标识col 1值与特定字符串（rs或chr）不匹配的行，并为这些标识行的col 1值附加前缀（chr）。所有具有匹配字符串的行应该按原样打印 - 不附加。

我的代码行至今：

awk '{if (! ($1 ~ /rs/ || $1 ~ /chr/)) {($1 == "chr"$1); print $0}}; else {print $0}' filename > newfilename

我不断收到与此代码的语法错误消息。

我可以自己完成识别和附加功能，但在将它们组合成一个命令时遇到问题。

来源

2015-08-24 Bob

' （$ 1 ==“chr”$ 1）'是一个条件，而不是一个赋值。使用单个等号进行分配。 – karakfa

用惯用的awk你可以重写这个作为

awk '$1!~/rs/ && $1!~/chr/ {$1="chr"$1}1'

，或者如果你喜欢

awk '!($1 ~ /rs/ || $1 ~ /chr/) {$1="chr"$1}1'

，或等效

awk '!(/^rs/ || /^chr/) {$1="chr"$1}1'

你能避免分配，因为没有进一步的行动除了用

打印

awk '!(/^rs/ || /^chr/) {print "chr"$0;next}1'

来源

2015-08-24 15:04:35 karakfa

谢谢！我使用了第二个选项，这是一种享受！ – Bob

小心 - '$ 1！〜/ rs/&& $ 1！〜/ chr /'不等于'！（$ 1〜/ rs/||/chr /）'，也不是'！$ 1〜/ rs/||/chr /）''相当于'！（/^rs/||/^ chr /）'，'print'chr“$ 0'不等于'$ 1 =”chr“$ 1; print'。 –

我假设第二个选项的意思是'！（$ 1〜/ rs/|| $ 1〜/ chr /）'？ – jas

有时，在多行写代码可以帮助你发现错误：

'{ 
    if (! ($1 ~ /rs/ || $1 ~ /chr/)) { 
     ($1 == "chr"$1); 
     print $0 
    } 
}; 
else {print $0}'

您将看到else超出了{...}

继续与您的代码，这将修复问题：

'{ 
    if (! ($1 ~ /rs/ || $1 ~ /chr/)) { 
     ($1 == "chr"$1); 
     print $0 
    }else 
     print $0 
}'

对于代码改进，请检查karakra的答案。

来源

2015-08-24 15:12:25 Kent

为语法正确的编写代码的方法是：

awk '!($1 ~ /rs/ || $1 ~ /chr/) {$1="chr"$1} 1' filename > newfilename

，但是要注意的是，分配可能会在文件中改变空格所以你可能真正想要的是：

awk '!($1 ~ /rs/ || $1 ~ /chr/) {sub(/^[[:space:]]*/,"&chr")} 1' filename > newfilename

来源

2015-08-24 16:58:16

awk if-then-else语句错误

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