2014-04-17 43 views
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列的我已经在Python以下数据框(实际数据帧是更大的,只是呈现出小样本):Python的箱线图出不同长度

 A  B  C  D  E  F 
0 0.43 0.52 0.96 1.17 1.17 2.85 
1 0.43 0.52 1.17 2.72 2.75 2.94 
2 0.43 0.53 1.48 2.85 2.83 
3 0.47 0.59 1.58  3.14 
4 0.49 0.80   

我转换数据框使用df.values到NumPy的然后将其传递给boxplot。

当我尝试从此熊猫数据框中创建箱图时,从每列中选取的值的数量限制为列中最少的值(在本例中为F列)。有没有什么方法可以将每列中的所有值打印出来?

注意:我使用df.dropna删除每列中缺少值的行。但是,这会将数据框重新调整为列长度的最小公分母,并搞乱了绘图。

import prettyplotlib as ppl 
import numpy as np 
import pandas 
import matplotlib as mpl 
from matplotlib import pyplot 

df = pandas.DataFrame.from_csv(csv_data,index_col=False) 
df = df.dropna() 
labels = ['A', 'B', 'C', 'D', 'E', 'F'] 
fig, ax = pyplot.subplots() 
ppl.boxplot(ax, df.values, xticklabels=labels) 
pyplot.show() 
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你应该张贴的numpy的/大熊猫代码 – mrKelley

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添加的代码。好吧,我看到发生了什么。我使用df.dropna删除每列中缺少值的行。但是,这会将数据框重新调整为列长度的最小公分母,并搞乱了绘图。任何解决方案 – user308827

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如何不放弃NaN?我认为'boxplot'会自己处理NaN值。 – HYRY

回答

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做到这一点,从重新发明轮子节约正确的方法,是使用了.boxplot()pandas,其中nan正确处理:

In [31]: 

print df 
     A  B  C  D  E  F 
0 0.43 0.52 0.96 1.17 1.17 2.85 
1 0.43 0.52 1.17 2.72 2.75 2.94 
2 0.43 0.53 1.48 2.85 2.83 NaN 
3 0.47 0.59 1.58 NaN 3.14 NaN 
4 0.49 0.80 NaN NaN NaN NaN 

[5 rows x 6 columns] 
In [32]: 

_=plt.boxplot(df.values) 
_=plt.xticks(range(1,7),labels) 
plt.savefig('1.png') #keeping the nan's and plot by plt 

enter image description here

In [33]: 

_=df.boxplot() 
plt.savefig('2.png') #keeping the nan's and plot by pandas 

enter image description here

In [34]: 

_=plt.boxplot(df.dropna().values) 
_=plt.xticks(range(1,7),labels) 
plt.savefig('3.png') #dropping the nan's and plot by plt 

enter image description here

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谢谢,我会试试这个。什么是 - =你有一些代码之前? – user308827

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这可以抑制终端中的无用输出。你看,'plt.boxplot'将返回3个项目的列表。 'plt.xticks'将返回一堆ticks对象。 –

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优秀,这个作品,谢谢! – user308827