蛋白质 - 蛋白质相互作用网络数据集的基准数据集

Question

我想将我的聚类算法专门应用于蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络。为此我需要一个具有参考的基准数据集，以便我可以验证我的结果。任何建议都将非常可观。

Answer 1

我建议您阅读van Brohee和van Helden（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17087821）对蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的聚类算法的评估。我认为他们的基准数据是可用的，他们在避免比较聚类算法和/或黄金标准时存在许多缺陷方面做得非常好。