建模蛋白质结构python

Question

我们可以使用ProDy来模拟蛋白质的结构吗？有没有其他的方法可以用Python来模拟蛋白质的结构？

谢谢

Answer 1

是的，ProDy可以完成这项工作。

如果您喜欢使用“only”Python，请检查PyMOL（http://www.pymol.org/） 以显示蛋白质和分子结构。

如果你想运行模拟，然后GROMACS包分子动力学模拟将是我的选择，但它写入（主​​要是）在C

http://www.gromacs.org/