错误消息

Question

我试图绘制在Windows 10中的R采用PCA我的数据集，但同时绘制我

长度为零的“标签”指定

消息

以下是在数据集和代码：

Taxon,L/D1 ,L/D4,L/DL,Di.Pro.,ST,H.Fo/H.Ch 
1,3,2.9,2.28,200,2,1 
1,1.33,2.3,2.44,225,2,1 
1,2,2.52,2.4,150,2,1 
1,3.5,2.75,2.32,125,2,1 
1,3.18,2.81,2,125,2,1 
1,2.35,3,2.82,125,2,1 
1,2.72,2.28,2.09,250,2,1 
2,3.6,2.82,2.65,125,4,1 
2,2.5,2.7,3.02,150,4,1 
2,3.2,2.6,2.7,150,4,1 
2,2.4,3.3,2.7,200,4,1 
2,3,2.87,3.08,175,4,1 
3,2,2.83,2,100,1,0.67 
3,4,2.66,2.26,100,1,0.67 
3,2.33,2.78,2.28,150,1,0.67 
3,2,2.83,2.3,100,1,0.67 
4,2.83,2.83,2.66,200,1,0.66 
4,3.66,2.57,2.27,100,1,0.66 
4,3.33,2.9,2.25,150,1,0.66 
4,4.33,3.09,2.15,125,1,0.66 
4,1.85,2.44,2.43,225,1,0.66 
4,2.85,2.57,2.65,175,1,0.66 
4,2.8,2.55,2.2,200,1,0.66 
4,1.85,2.57,2.04,175,1,0.66 
5,2.83,2.5,3,125,3,0.66 
5,2.8,4,3.14,200,3,0.66 
5,2,3.5,2.4,200,3,0.66 
5,3,3.42,2.9,150,3,0.66 
5,2.4,2.6,2.71,175,3,0.66 
5,4,3.37,2.52,125,3,0.66 
5,1.75,2.69,2.9,250,3,0.66 
5,2,2.54,2.76,200,3,0.66 
5,2.4,3.25,2.46,175,3,0.66 
6,3.5,3.14,2.48,75,5,1 
6,2.25,2.16,2.1,75,5,1 
6,3,3.23,2.77,125,5,1 
6,2.5,2.3,1.85,100,5,1 
6,2.95,2.71,2.14,100,5,1 
6,2.5,3.4,3.09,125,5,1 
6,2,2.57,2.3,100,5,1 
6,3,2.55,2.46,125,5,1 
7,3,4.76,2.94,100,1,1 
7,1.66,2.77,2.2,200,1,1 
7,2.16,2.8,2.4,250,1,1 
8,2.25,3.09,2.83,150,3,1 
8,3.5,3.5,2.88,125,3,1 
8,3.33,2.87,3.04,150,3,1 

library(vegan) 
daz= read.csv (file.choose()) 
cor(daz) 
daz.pca<-rda(daz) 
summary(daz.pca) 
PCA1,2 
daz.taxon.pca <- rda(daz[,c(2:7)],scale=T) 
par(pty="s") 
plot(scores(daz.taxon.pca,display="sites",choices=1),scores(daz.taxon.pca,display="sites",choices=2),type="n",xlab="PCA1 (99.69%)",ylab="PCA2 (0.19%)",xlim=c (-8.00,8.00),ylim=c(-2.00,1.50)) 

abline(v=0,lty=3) 
abline(h=0,lty=3) 

arrows(0,0,scores(daz.taxon.pca,display="species",choices=1),scores(daz.taxon.pca,display="species",choices=2),length=0.10,col="dark gray") 

text(scores(daz.taxon.pca,display="sites",choices=1),scores(daz.taxon.pca,display="sites",choices=2),as.character(daz$taxon),cex=0.7) 

错误text.default（分数（daz.taxon.pca，显示= “网站”，选择 = 1），：指定零长度“标签”

任何帮助？我对R很陌生，没有找到任何关于这个错误的解释。一般的代码似乎很好，除了当我添加

text(scores(daz.taxon.pca,display="sites",choices=1),scores(daz.taxon.pca,display="sites",choices=2),as.character(daz$taxon),cex=0.7) 

为情节，错误出现。任何提示将不胜感激。

Answer 1

您使用daz$taxon而不是daz$Taxon来访问daz变量中返回NULL的数据。

使用下面的代码在你的分析结束，它应该很好地工作：

text(scores(daz.taxon.pca, display="sites", choices=1), 
    scores(daz.taxon.pca, display="sites", choices=2), 
    as.character(daz$Taxon), 
    cex=0.7)