ggplot2避免被绘制点

我正在使用ggplot2创建一个点图。我的数据基本上是三列x_axis，y_axis和z_axis的形式，x_axis和y_axis一起表示一对，z_axis表示对数。ggplot2避免被绘制点

因此，我正在绘制x_axis与y_axis并使用z_axis为点着色。在某些情况下，我想跳过绘制一个特定的计数，例如：1的计数发生多次，有时我想跳过绘制1，但图例应显示1.以下是我的代码：

> new<-read.table("PB1_combo.txt", header=T, sep="\t") 
    > bp <-ggplot(data=new, aes(x_axis,y_axis, colour=factor(z_axis)), size=z_axis) +         
    geom_point(size=5) 
    > bp + ggtitle("PB1-PB1") 
    > last_plot()+ scale_colour_discrete(name="Counts") 
    > last_plot()+ theme_bw() 


    Sample data from PB1_combo.txt 
    x_axis y_axis z_axis 
    14  576  2 
    394  652  2 
    759  762  2 
    473  762  2 
    65  763  3 
    114  390  2 
    762  763  4 
    758  762  2 
    388  616  2 
    217  750  2 
    65  762  2 
    473  763  2 
    743  759  2 
    65  213  2 
    743  762  2

来源

2013-08-16 Mdhale

请给我们样本数据，说明你的问题。我们没有'PB1_combo.txt'。做到这一点的最好方法是模拟某些内容并发布代码或发布'dput（head（new））'。这两种方法都在[这里]描述（http://stackoverflow.com/q/5963269/903061）。 – Gregor

如果您不清楚如何使用数据编写问题，请阅读[this]（http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example） – SlowLearner

首先，您应该创建一个因子z_axis。这样，即使不是所有可能的值都存在，R也会意识到它们。

new$Count <- factor(new$z_axis)

（你真的应该选择比new的方式以外的其他名称。）

然后，你可以子集的数据。但是，并通过调用scale_color_discrete使用drop=FALSE显示在图例中缺失的水平：

ggplot(data=new[new$Count!="2", ], aes(x_axis,y_axis, colour=Count), size=z_axis) +         
    geom_point(size=5) + 
    ggtitle("PB1-PB1") + 
    scale_colour_discrete(name="Counts", drop=FALSE) + 
    theme_bw()

enter image description here

见this question，其实。

来源

2013-08-16 20:13:29 Peyton

佩顿：看起来很完美的解决方案。 – Mdhale

ggplot2避免被绘制点

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