使用cron安排R脚本

我想使用cron安排我的R脚本，但它不工作。看来R无法在cron中找到软件包。任何人都可以帮助我？谢谢。使用cron安排R脚本

以下是我的bash脚本

# source my profile 
. /home/winie/.profile 
# script.R will load packages 
R CMD BATCH /home/script.R

来源

2012-04-12 user1589

这是从R-帮助-1 – 2012-04-12 04:33:40

@TylerRinker交叉后，它会一直好，如果OP在两地都有交叉？我通常尝试使用R帮助，但有时候人们不回答，然后我在这里添加了一个赏金。 – 2012-09-18 02:57:39

可以在两个地方发帖，只是将每个帖子链接到不同的网站，或者帮助列出其他网站，这样有人就不会解决已经解决的问题。 – 2012-09-18 03:08:35

考虑这些提示

使用RSCRIPT（或利特勒），而不是R CMD BATCH
确保cron作业正在运行，因为你
确保脚本运行本身
测试它

我的箱子通过一个cronjob运行有所可见CRANberries调用的R脚本在详细模式下几次（其中我通过littler执行，但Rscript 也应该正常工作）。对于这一点，我的Ubuntu服务器上/etc/crontab的条目是

# every few hours, run cranberries 
16 */3 * * * edd  cd /home/edd/cranberries && ./cranberries.r

所以每十六个分结束每三个小时，一个shell命令正在用我的ID运行。它变成工作目录，并调用R脚本（它具有可执行模式等）。

见到这种情景，我其实只是运行脚本，并在它setwd()命令....

来源

2012-04-12 01:59:26

这很吸引人......你可以发布R行代码来使用setwd（）。我的意思是，如何从命令行传递参数？ – 2015-10-30 18:39:54

这里是一个固定的参数：'setwd（“/ home/edd/cranberries”）; ......脚本的其余部分......。但请查看[doctopt]（https://cran.rstudio.com/web/packages/docopt/index.html）以获取命令行参数处理... – 2015-10-30 20:08:14

使用cron安排R脚本

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